"ChroNoiR Episode.0" ist ein Anime, der in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Gesellschaft von einer strengen Hierarchie und technologischer Überwachung geprägt ist. Die Handlung konzentriert sich auf zwei Protagonisten, die in dieser unterdrückerischen Welt leben: Chrono, ein junger Mann mit einem geheimnisvollen Hintergrund, und Noir, eine mysteriöse Frau, die über außergewöhnliche Fähigkeiten verfügt. Beide werden durch Zufall zusammengeführt, als sie versuchen, einem skrupellosen Regime zu entkommen, das die Bevölkerung kontrolliert und unterdrückt.

Chrono, der als einfacher Bürger in den unteren Schichten der Gesellschaft lebt, wird ungewollt in eine Reihe von Ereignissen verwickelt, die ihn mit Noir in Kontakt bringen. Noir, die selbst auf der Flucht ist, besitzt die Fähigkeit, die Zeit zu manipulieren, was sie zu einer wertvollen Zielscheibe für das Regime macht. Gemeinsam schließen sie sich widerwillig zusammen, um gegen die übermächtigen Kräfte zu kämpfen, die sie verfolgen. Dabei decken sie nach und nach die dunklen Geheimnisse der Regierung auf, die weitreichende Konsequenzen für die gesamte Gesellschaft haben.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Mischung aus Action, Spannung und politischen Intrigen, während Chrono und Noir versuchen, ihre Vergangenheit zu verstehen und gleichzeitig eine Zukunft zu schaffen, die frei von Unterdrückung ist. Die Charaktere werden durch ihre gemeinsamen Erlebnisse und Konflikte tiefer entwickelt, wobei ihre Beziehung von anfänglichem Misstrauen zu einer starken Partnerschaft reift. Der Anime thematisiert dabei Fragen von Freiheit, Macht und den Preis, den man für Veränderungen zahlen muss.