In der zweiten Staffel von *Lockdown Zone: Level X* wird die Handlung fortgesetzt, nachdem die Protagonisten die Ereignisse des ersten Finales überstanden haben. Die Serie spielt in einer dystopischen Welt, in der mysteriöse Zonen, sogenannte "Lockdown Zones", entstanden sind. Diese Zonen sind durch undurchdringliche Barrieren abgeschirmt und beherbergen gefährliche Kreaturen sowie unerklärliche Phänomene. Die Hauptfiguren, eine Gruppe von Überlebenden, müssen sich weiterhin durch diese Zonen kämpfen, um das Geheimnis hinter ihrer Entstehung zu lüften und einen Weg zu finden, die Bedrohung zu stoppen.

Die Handlung konzentriert sich auf die Entwicklung der Charaktere und ihre Beziehungen zueinander, während sie sich neuen Herausforderungen stellen. Der Protagonist, Kaito, ein ehemaliger Wissenschaftler, spielt eine zentrale Rolle, da sein Wissen über die Zonen und ihre Technologie entscheidend für den Fortschritt der Gruppe ist. Zusammen mit der kämpferisch begabten Yuna und dem strategisch denkenden Ryo erkunden sie tieferliegende Ebenen der Zonen, die als "Level X" bezeichnet werden. Diese Ebenen sind noch gefährlicher und bergen unbekannte Risiken, darunter mächtige Feinde und rätselhafte Mechanismen, die die Gruppe an ihre Grenzen bringen.

Ein neuer Antagonist, bekannt als "Der Wächter", tritt in Erscheinung und stellt sich als Schlüsselfigur hinter den Lockdown Zones heraus. Seine Motive bleiben zunächst undurchsichtig, doch seine Handlungen deuten auf ein größeres, weitreichendes Ziel hin. Parallel dazu werden Rückblenden eingeführt, die Einblicke in die Vergangenheit der Charaktere und die Entstehung der Zonen geben. Diese Rückblenden tragen dazu bei, die Handlung zu vertiefen und die Motivationen der Figuren besser zu verstehen.

Die zweite Staffel baut auf den etablierten Konflikten auf und führt neue Wendungen ein, die die Spannung erhöhen. Die Gruppe wird mit moralischen Dilemmata konfrontiert, da sie Entscheidungen treffen muss, die nicht nur ihr eigenes Überleben, sondern auch das Schicksal der Welt betreffen. Die Handlung bleibt eng mit den wissenschaftlichen und mystischen Elementen der Zonen verbunden, wobei die Serie weiterhin auf eine ausgewogene Mischung aus Action, Drama und Rätseln setzt. Die Charakterentwicklung steht im Vordergrund, während die Handlung auf ein finales Ziel zusteuert, das in zukünftigen Staffeln weiterentwickelt werden könnte.