"Code:Breaker" ist eine Anime-Serie, die auf dem gleichnamigen Manga von Akimine Kamijyo basiert. Die Handlung dreht sich um Sakura Sakurakōji, eine Schülerin mit einem starken Gerechtigkeitssinn, die eines Tages Zeugin wird, wie ein mysteriöser Junge namens Rei Ōgami drei Gangster mit blauen Flammen verbrennt. Obwohl die Leichen später unversehrt gefunden werden, ist Sakura entschlossen, das Geheimnis hinter Rei zu lüften.

Rei ist ein sogenannter "Code:Breaker", ein Mitglied einer geheimen Organisation, die außerhalb des Gesetzes operiert, um Verbrecher zu eliminieren, die von der Justiz nicht bestraft werden können. Jeder Code:Breaker besitzt einzigartige übernatürliche Fähigkeiten, die sie als "Codes" bezeichnen. Rei nutzt seine Fähigkeit, blaue Flammen zu erzeugen, um seine Ziele zu vernichten. Die Organisation arbeitet nach einem strengen Kodex: Sie töten nur diejenigen, die es "verdienen", und lassen keine Spuren zurück.

Sakura, die sich weigert, Rei als Mörder zu akzeptieren, versucht, ihn zu verstehen und zu verändern. Dabei gerät sie immer wieder in gefährliche Situationen, da sie sich in die Missionen der Code:Breaker einmischt. Im Laufe der Serie werden weitere Mitglieder der Organisation vorgestellt, darunter Heike, ein junger Mann mit der Fähigkeit, Elektrizität zu kontrollieren, und Toki, ein ruhiger und analytischer Code:Breaker, der über telekinetische Kräfte verfügt. Jeder von ihnen hat eine eigene Motivation und einen eigenen Hintergrund, der ihre Handlungen beeinflusst.

Die Handlung vertieft sich in die Konflikte zwischen den Code:Breakers und ihren Gegnern, darunter auch andere übernatürliche Wesen und Organisationen, die ihre eigenen Ziele verfolgen. Ein zentrales Thema ist die Frage nach Gerechtigkeit und Moral, da die Code:Breakers oft gezwungen sind, grausame Entscheidungen zu treffen, um ihre Missionen zu erfüllen. Gleichzeitig wird die Beziehung zwischen Sakura und Rei immer komplexer, da sie versucht, ihn von seinem dunklen Pfad abzubringen, während er sich mit seiner eigenen Vergangenheit und seinen inneren Dämonen auseinandersetzt.

Die Serie kombiniert Action, übernatürliche Elemente und moralische Dilemmata, während sie die Entwicklung der Charaktere und ihre Beziehungen zueinander erforscht. Die Handlung bleibt dabei oft düster und konfrontiert die Zuschauer mit Fragen über die Natur von Gut und Böse sowie die Konsequenzen von Rache und Gerechtigkeit.