"Buddy Complex" ist eine Science-Fiction-Mecha-Anime-Serie, die in einer Zukunft spielt, in der zwei rivalisierende Fraktionen, die Free Pact Alliance (FPA) und die Großallianz Zogilia, in einem langwierigen Krieg verwickelt sind. Die Handlung beginnt mit dem Schüler Aoba Watase, der in Tokio lebt und ein normales Leben führt, bis er plötzlich von einem riesigen Roboter, dem Valiancer, angegriffen wird. Während des Angriffs wird Aoba von einem mysteriösen Piloten namens Hina Yumihara gerettet, die ihn in die Zukunft transportiert. Dort findet sich Aoba inmitten des Konflikts zwischen der FPA und Zogilia wieder.

Aoba wird in die FPA aufgenommen und pilotiert den Valiancer "Luxon", der über ein einzigartiges System namens "Coupling" verfügt. Dieses System ermöglicht es zwei Piloten, ihre Gedanken und Fähigkeiten zu synchronisieren, wodurch die Kampfkraft des Valiancers erheblich gesteigert wird. Aoba bildet ein Team mit dem erfahrenen Piloten Dio Weinberg, und die beiden entwickeln eine starke synergetische Verbindung. Während Aoba versucht, sich an seine neue Umgebung und die Herausforderungen des Krieges zu gewöhnen, erfährt er mehr über die Hintergründe des Konflikts und die Rolle, die Hina Yumihara dabei spielt.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass Hina aus der Zukunft stammt und eine Schlüsselrolle in den Ereignissen spielt, die den Krieg ausgelöst haben. Ihre Beziehung zu Aoba ist von zentraler Bedeutung, da sie versucht, die Zeitlinie zu korrigieren und eine Katastrophe zu verhindern. Die Handlung wird durch politische Intrigen, militärische Strategien und persönliche Konflikte vorangetrieben, während Aoba und seine Verbündeten gegen die übermächtigen Kräfte Zogilias kämpfen.

Die Charaktere sind vielfältig und zeigen unterschiedliche Motivationen und Entwicklungen. Aoba Watase ist ein typischer Protagonist, der sich von einem unerfahrenen Jugendlichen zu einem fähigen Piloten entwickelt. Dio Weinberg, sein Coupling-Partner, ist ein charismatischer und erfahrener Soldat, der Aoba unterstützt und anleitet. Hina Yumihara bleibt eine rätselhafte Figur, deren Handlungen und Vergangenheit im Laufe der Serie nach und nach enthüllt werden. Weitere Nebenfiguren, wie die FPA-Kommandantin Mayuka Nasu und der Zogilia-Pilot Bizon Gerafil, tragen zur Komplexität der Handlung bei.

Die Serie besteht aus 13 Episoden, die eine abgeschlossene Geschichte erzählen, gefolgt von einer zweiteiligen OVA, die zusätzliche Details und eine abschließende Auflösung bietet. "Buddy Complex" kombiniert Mecha-Action mit Zeitreiseelementen und einer Prise Drama, um eine packende und unterhaltsame Geschichte zu erzählen.