"Elfen Lied" (OVA) ist eine Anime-Adaption des gleichnamigen Mangas von Lynn Okamoto. Die Handlung spielt in einer Welt, in der eine neue menschliche Spezies, die Diclonii, existiert. Diese Spezies ähnelt äußerlich den Menschen, besitzt jedoch kleine Hörner und unsichtbare, telekinetische Arme, sogenannte Vektoren, die immense Zerstörungskraft entfalten können. Die Diclonii werden von der Regierung als Bedrohung angesehen und in geheimen Forschungseinrichtungen gefangen gehalten, wo sie grausamen Experimenten unterzogen werden.

Die Protagonistin Lucy ist eine junge Diclonius, die aus einem Labor flieht, in dem sie gefoltert und misshandelt wurde. Bei ihrer Flucht erleidet sie eine Kopfverletzung, die zu einer Persönlichkeitsspaltung führt. Fortan wechselt sie zwischen ihrer ursprünglichen, gewalttätigen Persönlichkeit und einer sanften, kindlichen Version namens Nyu. Nyu findet Zuflucht bei zwei jungen Menschen, Kouta und Yuka, die in einer Pension am Strand leben. Kouta, ein zurückhaltender Student, und Yuka, seine lebhafte Cousine, nehmen Nyu bei sich auf, ohne zunächst ihre wahre Natur zu erkennen.

Während Nyu versucht, ein friedliches Leben mit Kouta und Yuka zu führen, wird Lucy von den Behörden und Sondereinheiten gejagt, die sie als gefährliche Bedrohung betrachten. Gleichzeitig wird die Vergangenheit der Charaktere nach und nach enthüllt. Kouta und Lucy haben eine gemeinsame Vorgeschichte, die mit einem traumatischen Ereignis verbunden ist, das Koutas Erinnerungen beeinflusst hat. Diese Vergangenheit spielt eine zentrale Rolle in der Entwicklung der Beziehung zwischen den Charakteren und treibt die Handlung voran.

Parallel dazu wird die Geschichte anderer Diclonii erzählt, darunter Nana, eine junge Diclonius, die von der Regierung als Waffe eingesetzt wird. Nana entwickelt im Laufe der Handlung eine eigene Persönlichkeit und gerät in Konflikt mit ihrer Bestimmung. Die Interaktionen zwischen den Diclonii und den Menschen werfen Fragen nach Identität, Menschlichkeit und den moralischen Grenzen der Wissenschaft auf.

Die Handlung von "Elfen Lied" ist geprägt von Gewalt, emotionalen Konflikten und tragischen Momenten. Die Charaktere sind komplex und oft von ihren eigenen Ängsten und Traumata geplagt. Die OVA fasst die zentralen Handlungsstränge des Mangas zusammen und konzentriert sich auf die Beziehung zwischen Lucy, Nyu und Kouta sowie die Konsequenzen ihrer Vergangenheit. Die Geschichte endet offen, mit Andeutungen auf mögliche Fortsetzungen und ungelöste Konflikte.