Die Anime-Serie "X-Men" basiert auf den Marvel-Comics und adaptiert die Geschichten rund um die Mutanten, die in einer Welt leben, die sie sowohl fürchtet als auch hasst. Die Handlung konzentriert sich auf die X-Men, eine Gruppe von Mutanten unter der Führung von Professor Charles Xavier, der eine Schule für begabte Jugendliche betreibt. Diese Schule dient als Zufluchtsort für junge Mutanten, die dort lernen, ihre Kräfte zu kontrollieren und für eine friedliche Koexistenz zwischen Menschen und Mutanten zu kämpfen.

Die Serie beginnt mit der Entführung von Professor Xavier durch den geheimnisvollen Mutanten U-Men. Die X-Men, darunter Cyclops, Wolverine, Storm, Jean Grey, Beast und Rogue, machen sich auf die Suche nach ihm. Dabei stoßen sie auf verschiedene Feinde, darunter Magneto, der eine radikalere Herangehensweise vertritt und die Überlegenheit der Mutanten über die Menschheit propagiert. Magneto führt die Bruderschaft der Mutanten an, zu der Charaktere wie Mystique, Sabretooth und der Blob gehören. Der Konflikt zwischen den X-Men und der Bruderschaft bildet einen zentralen Handlungsstrang.

Im Laufe der Serie werden die X-Men mit zahlreichen Herausforderungen konfrontiert, darunter die Bedrohung durch Sentinels, riesige Roboter, die darauf programmiert sind, Mutanten zu jagen und zu vernichten. Ein weiterer wichtiger Handlungsbogen dreht sich um die Phoenix-Kraft, eine mächtige Energie, die Jean Grey in Besitz nimmt und sie sowohl zur Bedrohung als auch zur Hoffnung für die Welt macht. Die Serie behandelt auch Themen wie Diskriminierung, Identität und die moralischen Dilemmata, die mit übermenschlichen Kräften einhergehen.

Die Charaktere der Serie sind vielschichtig und entwickeln sich im Laufe der Handlung weiter. Cyclops fungiert oft als taktischer Anführer, während Wolverine als Einzelgänger mit einem rauen Äußeren und einem guten Herzen dargestellt wird. Storm verkörpert Stärke und Weisheit, während Jean Grey mit ihrer inneren Zerrissenheit und der Macht der Phoenix-Kraft kämpft. Beast, mit seinem blauen Fell und überragender Intelligenz, steht für die wissenschaftliche Seite der X-Men, und Rogue ringt mit der Fähigkeit, die Kräfte und Erinnerungen anderer zu absorbieren, was sie sowohl zu einer mächtigen als auch verletzlichen Figur macht.

Die Serie verbindet actionreiche Szenen mit tiefgründigen Charakterstudien und moralischen Fragen, die die Komplexität der Beziehungen zwischen Mutanten und Menschen sowie innerhalb der Mutantengemeinschaft selbst beleuchten. Die Handlung bleibt eng an den Comic-Vorlagen, während sie gleichzeitig eigenständige Erzählungen entwickelt, die sowohl Fans der Comics als auch neue Zuschauer ansprechen.