"Cyborg 009" (Film) ist eine Adaption des gleichnamigen Mangas von Shotaro Ishinomori. Die Handlung dreht sich um neun Individuen, die von einer skrupellosen Organisation entführt und in Cyborgs verwandelt wurden, um als Waffen eingesetzt zu werden. Jeder der neun Protagonisten verfügt über einzigartige Fähigkeiten, die durch ihre mechanischen Modifikationen ermöglicht werden. Der Hauptcharakter, Joe Shimamura (Cyborg 009), besitzt beispielsweise die Fähigkeit, sich für eine Minute mit Überschallgeschwindigkeit zu bewegen.

Die Geschichte beginnt mit der Flucht der neun Cyborgs aus den Fängen der Organisation, die sie erschaffen hat. Diese Organisation, bekannt als Black Ghost, verfolgt das Ziel, durch die Schaffung von Supersoldaten globale Konflikte zu schüren und daraus Profit zu schlagen. Die Cyborgs, die sich ihrer unmenschlichen Behandlung bewusst werden, beschließen, sich gegen ihre Schöpfer zu stellen und die Pläne von Black Ghost zu vereiteln.

Im Laufe des Films schließen sich die neun Cyborgs zusammen, um ihre individuellen Fähigkeiten zu nutzen und als Team gegen ihre Verfolger zu kämpfen. Dabei werden sie mit moralischen Dilemmata konfrontiert, da sie einerseits ihre Menschlichkeit bewahren wollen, andererseits aber gezwungen sind, ihre mechanischen Fähigkeiten einzusetzen, um zu überleben. Die Charaktere entwickeln sich im Verlauf der Handlung weiter, wobei ihre Vergangenheiten und Motivationen näher beleuchtet werden.

Der Film thematisiert die Spannung zwischen Menschlichkeit und Technologie, während die Cyborgs versuchen, ihre Identität in einer Welt zu finden, die sie sowohl als Bedrohung als auch als Werkzeug betrachtet. Die Handlung gipfelt in einem finalen Konflikt, in dem die Cyborgs ihre Fähigkeiten nutzen müssen, um nicht nur sich selbst, sondern auch die Welt vor den zerstörerischen Absichten von Black Ghost zu retten.