"Malevolent Spirits: Mononogatari" ist eine Anime-Serie, die sich mit der Beziehung zwischen Menschen und übernatürlichen Wesen, den sogenannten Tsukumogami, beschäftigt. Tsukumogami sind Geister, die in alten Gegenständen wohnen und nach langer Zeit ein Bewusstsein entwickeln. Die Handlung dreht sich um Kunato Hyouma, einen jungen Mann, der aus einer Familie von Tsukumogami-Beschwörern stammt. Hyouma hasst Tsukumogami zutiefst, da er sie für den Tod seiner Familie verantwortlich macht. Trotz seiner Abneigung wird er gezwungen, mit diesen Geistern zusammenzuarbeiten, um eine friedliche Koexistenz zwischen Menschen und Tsukumogami zu ermöglichen.

Hyouma wird an die Saenome-Familie geschickt, eine Gruppe von Experten, die sich auf die Kontrolle und den Schutz von Tsukumogami spezialisiert hat. Dort trifft er auf Botan Nagatsuki, ein Mädchen, das selbst ein Tsukumogami ist und in einer menschlichen Form lebt. Botan ist freundlich und neugierig, was im starken Kontrast zu Hyoumas ablehnender Haltung steht. Durch ihre Interaktionen beginnt Hyouma, seine Vorurteile zu hinterfragen und die komplexe Natur der Tsukumogami zu verstehen.

Die Serie erkundet die Spannungen zwischen den beiden Welten, wobei Hyouma und Botan oft in Konflikte verwickelt werden, die sowohl menschliche als auch übernatürliche Ursachen haben. Dabei werden Themen wie Vergebung, Verständnis und die Möglichkeit der Versöhnung zwischen scheinbar unvereinbaren Gegensätzen behandelt. Neben Hyouma und Botan spielen weitere Charaktere eine wichtige Rolle, darunter Mitglieder der Saenome-Familie, die unterschiedliche Ansichten über den Umgang mit Tsukumogami vertreten, sowie andere Tsukumogami, die ihre eigenen Ziele und Motivationen haben.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Mischung aus actionreichen Kämpfen, emotionalen Momenten und philosophischen Fragen über das Zusammenleben von Menschen und Geistern. Die Serie bleibt dabei stets fokussiert auf die Entwicklung der Charaktere, insbesondere Hyoumas inneren Konflikt und seine langsame Annäherung an eine friedliche Lösung.