Die dritte Staffel von "Fire Force" setzt die Handlung der vorherigen Staffeln fort und vertieft die Konflikte um die mysteriösen Selbstentzündungen und die Existenz der Infernals. Die Serie spielt in einer dystopischen Welt, in der Menschen spontan in Flammen aufgehen und zu feuerspeienden Kreaturen, den sogenannten Infernals, werden. Die Special Fire Force Company 8, angeführt von Captain Akitaru Ōbi, spielt eine zentrale Rolle bei der Bekämpfung dieser Bedrohung. Protagonist Shinra Kusakabe, ein Mitglied von Company 8, besitzt die Fähigkeit, seine Füße in Flammen zu setzen, und strebt danach, ein Held zu werden, während er gleichzeitig die Wahrheit über den Tod seiner Familie aufdeckt.

In der dritten Staffel wird die Handlung komplexer, da sich die Spannungen zwischen den verschiedenen Fire Force Companies und der Geheimen Evangelischen Kirche verschärfen. Die Kirche, die eine zentrale Macht in der Gesellschaft darstellt, wird als Urheber der Selbstentzündungen und der Infernals entlarvt. Die Handlung konzentriert sich auf die Enthüllung der wahren Absichten der Kirche, die darauf abzielen, eine neue Weltordnung zu schaffen, indem sie die Menschheit in ein kollektives Bewusstsein, den sogenannten "Evangelist", integriert.

Shinra und seine Verbündeten, darunter Arthur Boyle, Maki Oze und Iris, müssen sich gegen mächtige Gegner wie den Evangelist und seine Anhänger, die White-Clad, behaupten. Die White-Clad, eine fanatische Sekte, die die Pläne der Kirche unterstützt, stellen eine erhebliche Bedrohung dar. Im Laufe der Staffel wird Shinras Verbindung zu seinem Bruder Sho Kusakabe, der zu den White-Clad gehört, weiter erforscht. Sho, der zunächst als Gegner auftritt, beginnt, seine Loyalität infrage zu stellen, was zu emotionalen Konflikten und dramatischen Wendungen führt.

Die Staffel beleuchtet auch die Hintergründe der Charaktere und ihre Motivationen. So wird beispielsweise die Vergangenheit von Captain Leonard Burns, dem Leiter der Company 1, und seine Verbindung zur Kirche näher untersucht. Gleichzeitig wird die Rolle von Haumea, einem Mitglied der White-Clad, als zentrale Antagonistin weiter ausgebaut. Ihre Fähigkeit, die Gedanken anderer zu manipulieren, macht sie zu einer gefährlichen Gegenspielerin.

Die Handlung gipfelt in einem epischen Konflikt, bei dem Shinra und seine Verbündeten gegen die White-Clad und den Evangelist kämpfen, um die Zerstörung der Welt zu verhindern. Dabei werden die Grenzen von Shinras Kräften getestet, als er eine neue Form seiner Fähigkeiten entdeckt, die ihn in die Lage versetzt, die Realität selbst zu beeinflussen. Die Staffel endet mit einem offenen Finale, das Raum für weitere Entwicklungen lässt und die Zuschauer auf eine mögliche Fortsetzung vorbereitet.