"Sorcery in the Big City" spielt in einer modernen Metropole, in der Magie und Technologie nebeneinander existieren. Die Handlung dreht sich um die junge Protagonistin Aiko, eine angehende Zauberin, die in die Großstadt zieht, um ihre magischen Fähigkeiten an der renommierten Akademie für Arkanwissenschaften zu verbessern. Aiko stammt aus einer ländlichen Region, in der Magie eher traditionell und begrenzt praktiziert wird, und sieht sich in der Stadt mit einer völlig neuen Welt konfrontiert, in der Magie in den Alltag integriert ist.

Aikos Weg ist geprägt von Herausforderungen, sowohl akademischer als auch persönlicher Natur. Sie trifft auf eine vielfältige Gruppe von Kommilitonen, darunter den technikbegeisterten Riku, der magische Artefakte entwickelt, und die mysteriöse Yuna, die über verbotene Zaubersprüche forscht. Zusammen bilden sie ein Team, das sich sowohl mit den Anforderungen der Akademie als auch mit externen Bedrohungen auseinandersetzen muss. Eine dieser Bedrohungen ist eine Untergrundorganisation, die die Magie der Stadt für ihre eigenen Zwecke missbraucht und dabei gefährliche Experimente durchführt.

Im Laufe der Serie wird Aikos Vergangenheit näher beleuchtet, insbesondere ihre Verbindung zu einer alten magischen Blutlinie, die eine Schlüsselrolle in der Geschichte der Stadt spielt. Diese Enthüllungen führen zu Konflikten innerhalb der Gruppe, da Aiko lernen muss, ihre neu entdeckten Kräfte zu kontrollieren und gleichzeitig ihre Freundschaften zu bewahren. Die Handlung entwickelt sich zu einem komplexen Geflecht aus Intrigen, moralischen Dilemmata und der Frage, wie Magie in einer modernen Gesellschaft eingesetzt werden sollte.

Die Serie verbindet Elemente des Urban Fantasy-Genres mit einer Coming-of-Age-Geschichte, wobei die Charaktere sowohl mit ihren inneren Ängsten als auch mit äußeren Gefahren konfrontiert werden. Die Handlung bleibt dabei stets eng mit der Entwicklung der Hauptfiguren verknüpft, insbesondere Aikos Reifeprozess und ihre wachsende Verantwortung gegenüber ihrer Gemeinschaft.