"Persona 3 the Movie #3 Falling Down" setzt die Handlung der vorherigen Filme fort und vertieft die Konflikte um die Protagonisten und die mysteriöse Gruppe SEES (Specialized Extracurricular Execution Squad). Der Film konzentriert sich auf die Entwicklung der Charaktere und die zunehmende Bedrohung durch die "Dark Hour", eine versteckte Zeitspanne zwischen einem Tag und dem nächsten, in der gefährliche Schattenwesen auftauchen.

Die Geschichte beginnt mit Makoto Yuki, dem stillen Protagonisten, und seinen Gefährten, die weiterhin gegen die Schatten kämpfen, die die Stadt bedrohen. Die Gruppe erfährt mehr über die wahre Natur der Dark Hour und die Verbindung zu Tartarus, einem riesigen Turm, der nur während dieser Zeit erscheint. Im Mittelpunkt steht die zunehmende Spannung innerhalb der Gruppe, insbesondere durch die Ankunft von Ryoji Mochizuki, einem mysteriösen Transferstudenten, der eine zentrale Rolle in den Ereignissen spielt.

Ryoji entpuppt sich als Inkarnation des Todes, bekannt als Nyx, der die Menschheit bedroht. Seine Anwesenheit löst eine Reihe von Ereignissen aus, die die Gruppe vor schwierige Entscheidungen stellt. Die Charaktere müssen sich mit ihren eigenen Ängsten, Verlusten und der unvermeidlichen Konfrontation mit dem Schicksal auseinandersetzen. Besonders Makoto wird mit der Last konfrontiert, eine Entscheidung zu treffen, die das Schicksal der Welt beeinflussen wird.

Der Film beleuchtet auch die Hintergründe und Motivationen der Nebencharaktere, wie Akihiko, Mitsuru, Junpei und Yukari, die jeweils mit ihren eigenen inneren Kämpfen und Beziehungen zu kämpfen haben. Die Handlung führt zu einem emotionalen Höhepunkt, als die Gruppe erkennt, dass sie möglicherweise nicht in der Lage sein wird, die drohende Katastrophe abzuwenden, und dass Opfer unvermeidlich sein könnten.

"Falling Down" baut auf den vorherigen Filmen auf und bereitet den Weg für den finalen Konflikt, der im nächsten Film seinen Abschluss finden wird. Der Film kombiniert actionreiche Szenen mit tiefgreifenden emotionalen Momenten und erkundet Themen wie Schicksal, Verlust und die menschliche Natur.