Die OVA "Guy" erzählt die Geschichte eines jungen Mannes namens Guy, der in einer postapokalyptischen Welt lebt, die von Kriegen und Umweltzerstörung geprägt ist. Die Menschheit hat sich in unterirdische Städte zurückgezogen, um den lebensfeindlichen Bedingungen an der Oberfläche zu entgehen. Guy, ein talentierter Kämpfer, wird von einer mysteriösen Organisation rekrutiert, um an einem geheimen Projekt teilzunehmen, das darauf abzielt, die Erde wieder bewohnbar zu machen. Dabei wird er mit einer Reihe von Herausforderungen konfrontiert, darunter gefährliche Experimente, politische Intrigen und die Konfrontation mit anderen Kämpfern, die ähnliche Fähigkeiten besitzen.

Im Zentrum der Handlung steht Guys Entwicklung von einem naiven jungen Mann zu einem entschlossenen Krieger, der nicht nur um sein eigenes Überleben kämpft, sondern auch die Zukunft der Menschheit beeinflussen kann. Seine Begegnungen mit anderen Charakteren, darunter die Wissenschaftlerin Lain und der undurchsichtige Anführer der Organisation, Zeke, spielen eine entscheidende Rolle in seiner Reise. Lain, die an der Entwicklung der Technologie beteiligt ist, die die Erde retten soll, wird zu einer wichtigen Verbündeten, während Zeke als Antagonist fungiert, dessen wahre Absichten im Verlauf der Geschichte immer fragwürdiger werden.

Die Handlung ist geprägt von Action-Szenen, die Guys Kampffähigkeiten in den Vordergrund stellen, sowie von Momenten der Reflexion über die moralischen Dilemmata, die mit den wissenschaftlichen Experimenten und der Rettung der Menschheit verbunden sind. Die OVA kombiniert Elemente des Science-Fiction-Genres mit einer düsteren Atmosphäre und einer Erzählung, die sich auf die persönliche Entwicklung des Protagonisten und die komplexen Beziehungen zwischen den Charakteren konzentriert.