"Natsuki Crisis" ist eine OVA, die in einer futuristischen Welt angesiedelt ist, in der Technologie und menschliche Emotionen auf komplexe Weise miteinander verflochten sind. Die Handlung dreht sich um Natsuki, eine junge Frau, die in einer von Konflikten geprägten Gesellschaft lebt. Sie ist eine talentierte Mechanikerin, die sich auf die Reparatur und Verbesserung von Kampfrobotern spezialisiert hat. Diese Roboter, bekannt als "Mecha", spielen eine zentrale Rolle in den militärischen Auseinandersetzungen, die die Welt erschüttern.

Natsuki wird in einen Konflikt hineingezogen, als ihr Bruder, ein hochrangiger Militäringenieur, unter mysteriösen Umständen verschwindet. Auf der Suche nach ihm stößt sie auf eine geheime Organisation, die fortschrittliche Mecha-Technologie für ihre eigenen Zwecke missbraucht. Diese Organisation plant, die Kontrolle über die Regierung zu übernehmen, indem sie die Mecha für terroristische Anschläge einsetzt. Natsuki muss sich mit ihrer eigenen Vergangenheit auseinandersetzen, während sie versucht, die Pläne der Organisation zu durchkreuzen und ihren Bruder zu retten.

Im Laufe der Geschichte trifft Natsuki auf verschiedene Charaktere, die ihre Mission beeinflussen. Dazu gehört ein mysteriöser Pilot namens Rei, der über außergewöhnliche Fähigkeiten im Umgang mit Mecha verfügt und Natsuki bei ihren Bemühungen unterstützt. Gleichzeitig gibt es eine rivalisierende Mechanikerin, die Natsukis Fähigkeiten herausfordert und eine ambivalente Rolle in der Geschichte spielt. Die Beziehungen zwischen den Charakteren sind von Misstrauen und Zusammenarbeit geprägt, was die Dynamik der Handlung weiter vertieft.

Die OVA behandelt Themen wie die Ethik der Technologie, die Auswirkungen von Krieg auf die Gesellschaft und die Bedeutung von familiären Bindungen. Die Handlung ist geprägt von intensiven Kampfszenen, in denen die Mecha im Mittelpunkt stehen, sowie von Momenten der Reflexion über die Konsequenzen menschlicher Handlungen. Natsukis Entwicklung von einer einfachen Mechanikerin zu einer Schlüsselfigur im Kampf gegen die geheime Organisation bildet den emotionalen Kern der Geschichte.