"Coral Reef Legend: Elfie of the Blue Sea" ist ein Anime-TV-Special, das eine abgeschlossene Geschichte erzählt, die im Kontext einer mystischen Unterwasserwelt spielt. Die Handlung dreht sich um Elfie, ein junges Mädchen, das in einem Dorf am Rande eines Korallenriffs lebt. Elfie ist eine Waise und wird von den Dorfbewohnern aufgezogen, die ihr eine besondere Verbindung zur Natur und zum Meer zuschreiben. Sie besitzt die Fähigkeit, mit Meeresbewohnern zu kommunizieren, was sie zu einer wichtigen Figur in ihrer Gemeinschaft macht.

Die Geschichte beginnt, als das Dorf von einer mysteriösen Bedrohung heimgesucht wird: Das Korallenriff, das die Lebensgrundlage der Dorfbewohner darstellt, beginnt zu sterben. Gleichzeitig tauchen seltsame Kreaturen aus der Tiefe auf, die das Dorf angreifen. Elfie erfährt, dass diese Ereignisse mit einer alten Legende zusammenhängen, die von einem mächtigen Wesen namens Leviathan erzählt, das im Meer gefangen gehalten wurde. Der Legende nach wurde Leviathan von den Vorfahren der Dorfbewohner versiegelt, um das Gleichgewicht der Natur zu bewahren. Nun scheint das Siegel gebrochen zu sein, und die Kreaturen sind ein Zeichen für Leviathans bevorstehende Rückkehr.

Elfie beschließt, die Bedrohung zu bekämpfen, und begibt sich auf eine Reise in die Tiefen des Ozeans. Dabei wird sie von einem jungen Fischer namens Kai begleitet, der ihr Freund und Verbündeter wird. Auf ihrer Reise treffen sie auf verschiedene Meeresbewohner, die ihnen Hinweise auf Leviathans Aufenthaltsort geben. Gleichzeitig erfährt Elfie mehr über ihre eigene Herkunft und die wahre Bedeutung ihrer Fähigkeit, mit den Tieren zu kommunizieren. Es stellt sich heraus, dass sie eine direkte Nachfahrin derjenigen ist, die Leviathan einst versiegelten.

Als Elfie und Kai schließlich Leviathan gegenüberstehen, müssen sie eine schwierige Entscheidung treffen: Soll Leviathan erneut versiegelt werden, oder gibt es eine Möglichkeit, Frieden mit dem Wesen zu schließen? Die Handlung gipfelt in einem emotionalen Konflikt, bei dem Elfie ihre Verbindung zur Natur und ihre Verantwortung gegenüber ihrer Gemeinschaft unter Beweis stellen muss. Die Geschichte endet mit einer Lösung, die sowohl das Überleben des Dorfes als auch das Gleichgewicht der Natur sichert, wobei Elfies Rolle als Vermittlerin zwischen Mensch und Natur im Mittelpunkt steht.