"Junk Boy" (OVA) handelt von einem jungen Mann namens Takuya, der in einer dystopischen Zukunft lebt, in der die Gesellschaft von einer strengen Hierarchie und technologischer Kontrolle geprägt ist. Takuya, ein sogenannter "Junk Boy", verdient seinen Lebensunterhalt damit, Schrott und verlorene Technologie in den Ruinen der Stadt zu sammeln. Sein Alltag ändert sich schlagartig, als er auf ein mysteriöses Mädchen namens Aya trifft, das auf der Flucht vor einer mächtigen Organisation zu sein scheint. Aya trägt ein seltsames Artefakt bei sich, das von großer Bedeutung zu sein scheint.

Die Handlung entwickelt sich, als Takuya beschließt, Aya zu helfen, obwohl er sich der Gefahren bewusst ist, die mit der Konfrontation der Organisation verbunden sind. Die beiden fliehen durch die verfallenen Stadtlandschaften und werden dabei von Agenten der Organisation verfolgt. Im Laufe der Geschichte enthüllt sich, dass das Artefakt, das Aya bei sich trägt, eine Schlüsseltechnologie ist, die die Machtstrukturen der Gesellschaft ins Wanken bringen könnte. Takuya und Aya müssen nicht nur ihre Verfolger abwehren, sondern auch die Geheimnisse der Technologie und ihrer eigenen Vergangenheit entschlüsseln.

Die Charaktere sind geprägt von ihren individuellen Motivationen und Hintergründen. Takuya verkörpert den typischen Antihelden, der zunächst nur an sein eigenes Überleben denkt, sich aber im Laufe der Geschichte weiterentwickelt. Aya hingegen ist rätselhaft und scheint mehr über die Welt und das Artefakt zu wissen, als sie preisgibt. Die antagonistische Organisation bleibt weitgehend undurchsichtig, was ihre genauen Ziele und Methoden betrifft, was der Geschichte eine zusätzliche Spannungsebene verleiht.

Die OVA kombiniert Elemente des Cyberpunk-Genres mit einer persönlichen Geschichte über Vertrauen, Widerstand und die Suche nach Freiheit in einer unterdrückerischen Welt. Die Handlung ist dicht und schnelllebig, mit einem Fokus auf Action und die Entwicklung der Beziehung zwischen Takuya und Aya.