Starscream diente vor dem Krieg als Luftkommandant der Energon Seekers, Cybertrons Elite-Luftkämpfern. Er blieb neutral, leitete eine Orbitalstation, die Dark Energon produzierte, verbot jedoch dessen Einsatz aus Sicherheitsgründen. Sein Streben galt der Wiedererlangung der Matrix of Leadership, um ein Prime zu werden und Cybertrons Goldenes Zeitalter wiederherzustellen, was ihn zu Megatrons Rebellion führte. Doch er sah Megatrons Anti-Kasten-Rhetorik als Fassade für Machtgier und verachtete später dessen Besessenheit von Dominanz.

Zu Kriegsbeginn bewachte Starscream Sentinel Prime im Altihex Casino. Als Decepticons angriffen, zwang Sentinels Feigheit Starscream, seine Seekers anzuweisen, den Prime ins Kaon-Gefängnis statt nach Iacon zu bringen, was Megatrons Interesse weckte. Starscream blieb vorsichtig, stationierte Seekers auf Mondbasis Eins und Trypticon Station und verkaufte ihre Dienste an Megatron. Als dieser Dark Energon in Trypticon entdeckte und trotz Starscreams Warnungen gewaltsam darauf zugriff, schwor Starscream nach Megatrons Kontrolle über den Stoff den Decepticons die Treue und verriet seinen neutralen Posten.

Später kontaktierte Starscream Optimus Prime, erkundete Belohnungen für Megatrons Entfernung. Er befreite Sentinel Prime, bot ihm Sühne für dessen Feigheit an, um Frieden mit Optimus zu vermitteln und selbst Prime zu werden. Der Plan scheiterte, als Megatron Sentinel tödlich verwundete. Starscream holte den Key of Power aus der Hall of Justice, wurde aber von Blackout daran gehindert, den Key of Justice von Sentinels Leiche zu nehmen. Nach einem Patt-Kampf mit Megatron verschonte dieser ihn wegen seines Kampfwerts.

Seine Haltung zu Dark Energon wandelte sich: Zunächst gegen den Einsatz, akzeptierte er es, als Megatron befahl, Omega Supreme im Tausch für mehr Substanz zu besiegen. Starscreams Truppen siegten, ermöglichten Megatron, Cybertrons Kern zu korrumpieren. Als der Planet unbewohnbar wurde, verfolgte Starscream die Ark an Bord von Trypticon (nun das Nemesis-Kriegsschiff), doch beide Schiffe trennten sich im Space-Bridge-Transport.

In der Schlacht um Iacon widersetzte sich Starscream Megatron oft. Er verweigerte den Einsatz von Dark-Energon-Bombern, beanspruchte die Schiffe als sein Eigentum, und erklärte sich voreilig zum Decepticon-Anführer, als er Megatrons Tod gegen Omega Supreme annahm. Megatron befahl ihm später, Omega anzugreifen, drohte bei Rückzug mit Tod. Starscream lauerte Optimus unter Iacons Ruinen auf, fing ihn ein und prahlte, bis Megatron ihn beschoss. Als Metroplex Megatron zerschmetterte, übernahm Starscream erneut das Kommando, erwies sich jedoch als unfähig, verschwendete Ressourcen für selbstverherrlichende Monumente und Sendungen. Er inhaftierte Kritiker, brach eine Mission zur Energon-Rückeroberung von den Autobots ab und verhaftete die Combaticons trotz Teilerfolgs. Während seiner Krönung kehrte Megatron zurück, übernahm die Führung und verbannte ihn.

Rache suchend, bot Starscream Grimlock in Shockwaves Lab Freiheit gegen Dienst an. Grimlock lehnte gewaltsam ab, schleuderte ihn gegen eine Konsole. Später auf Erde fing Starscream Arcee und Cliffjumper, um eine Autobot-Übertragung zu decodieren. Nach erfolgloser Folter übergab er sie Shockwave zur cortical psychic patch-Extraktion. Dies enthüllte Optimus' Standort auf Erde, doch Arcee und Cliffjumper überwältigten ihn und zerstörten die Space Bridge. Als Megatrons temporärer Nachfolger auf Erde errichtete Starscream eine Energon-Mine. Als Vehicons Cliffjumper fingen, durchbohrte Starscream dessen Spark Chamber und ließ den Körper entsorgen. Später jagte er Arcee, wurde aber von Optimus und Bumblebee vereitelt.

Durchweg zeigte Starscream impulsive Züge: strategische Brillanz vermischt mit Panik, Feigheit und theatralischen Gesten. Seine Intrigen blieben Megatron durchschaubar, der sie als Herausforderung und perverse Belustigung tolerierte. Starscreams mutierter Spark ermöglichte in manchen Kontinuitäten sein Bewusstsein über physische Zerstörung hinaus.

Starscream