Dr. Zed ist der primäre Antagonist der Erzählung. Ursprünglich war er Forscher für die Biotope Company unter Chrom und Phossa Molybdenum und untersuchte das heilende Quellwasser im Okoya-Wald. Ihre Forschung identifizierte den Großen Baum als Quelle des Wassers. Als Chrom und Phossa, nachdem sie den heiligen Status des Baums für eine Zarude-Truppe entdeckt hatten, das Projekt aussetzten, um eine respektvolle Alternative zu suchen, widersetzte sich Dr. Zed vehement und argumentierte, die Heilkraft könne unzählige Menschenleben retten und dürfe nicht verzögert werden. Sein Scheitern, sie zu überzeugen, löste einen psychotischen Zusammenbruch aus, dokumentiert in einem Videolog, in dem er beschloss, die Molybdenums zu beseitigen, um die Führung zu übernehmen und seine Methoden zu rechtfertigen. Er verfolgte ihr Auto, forderte ihre Forschungsdaten und jagte ihr Fahrzeug von der Straße, als sie behaupteten, diese zerstört zu haben. Nachdem Chrom und Phossa ihren Säuglingssohn Al zum Schutz flussabwärts schickten, stahl Dr. Zed ihre Wasserprobe und ließ sie in der folgenden Explosion umkommen. Der Säugling wurde später von einem Zarude namens Koko gefunden und aufgezogen.

Danach übernahm Dr. Zed die Kontrolle über Biotope. Im folgenden Jahrzehnt leitete er Forschungsteams unter der Führung seiner Assistentin Sharon in einer erfolglosen Suche nach dem Großen Baum. Seine Chance kam, als Ash Ketchum mit Koko, der ein Anhänger mit beschädigten Baumdaten besaß, im Biotope-Hauptquartier eintraf. Nachdem er Kokos Identität als Al Molybdenum bestätigt und den angeblichen Unfalltod seiner Eltern erklärt hatte, brachte Dr. Zed heimlich einen Peilsender am Jungen an. Dies ermöglichte ihm, Koko mit einem Forschungsteam, schweren Fahrzeugen und einem spinnenartigen Panzer zum Großen Baum zu folgen. Bei der Ankunft befahl er Raketenangriffe auf den Baum, um seine Energie zu extrahieren, und ignorierte ökologische Zerstörung und die Proteste seines Teams. Als Ash und Koko ihn konfrontierten, fing er sie mit den Fadenschüssen seiner vier Ariados ein und sperrte sie ein, obwohl sie entkamen. Während des Konflikts warf Dr. Zed den Piloten des Panzers aus, übernahm die Kontrolle und gestand den Mord an Kokos Eltern. Er kämpfte zerstörerisch gegen Ash, Koko und Dschungel-Pokémon und wertete ihren Widerstand als Schwäche. Seine Niederlage erfolgte, als Pikachu die Steuerung des Panzers mit Eisenrumpf deaktivierte. Auf der Flucht wurde Dr. Zed von Koko in der Nähe eines Flusses in die Enge getrieben. Nach einem Kampf fing Koko ihn mit einer Ranke und ließ ihn über dem Wasser baumeln. Aufgrund seines Geständnisses und durch Team Rocket geleakter Videoaufnahmen, die ihn mit den Morden in Verbindung brachten, wurde er verhaftet und war letztmals zu sehen, wie er trotzig während der Übergabe an die Polizei starrte.

Öffentlich gab sich Dr. Zed als ruhiger, vernünftiger Wissenschaftler, der sich der menschlichen Weiterentwicklung durch die Kraft der Quelle widmete. Diese Fassade verbarg tiefe Egomanie, Grausamkeit und die Bereitschaft, Mord und ökologische Verwüstung zu begehen, um seine Ziele zu erreichen. Er vertrat supremacistische Ansichten und hielt Menschen für inherently würdiger, die Kraft der Quelle zu nutzen, als Pokémon. Seine geistige Gesundheit verschlechterte sich bei Herausforderungen, was zu gewalttätigen Ausbrüchen und öffentlichen Zusammenbrüchen führte, besonders wenn Untergebene seine Methoden infrage stellten. Er zeigte keine Loyalität und opferte oder verwarf Kollegen ohne Zögern. In der Niederlage zeigte er Feigheit, indem er versuchte zu fliehen oder sogar Selbstmord zu begehen, um den Konsequenzen zu entgehen. Aufzeichnungen seiner Verbrechen, einschließlich des Mordes an den Molybdenums, unterstreichen seine mangelnde Reue.

Dr. Zed setzte vier Ariados ein, um Gegner mit Fadenschuss zu immobilisieren. Abgesehen von diesen Pokémon waren seine primären Werkzeuge technologischer Natur, wie Peilsender und der schwer bewaffnete Panzer, der eingesetzt wurde, um den Großen Baum anzugreifen.

Dr. Zed