Kenji Kondo wird als Pilot der ersten Generation für Fafner auf der Insel Tatsumiya eingeführt, wo er der Einheit Mark Acht (VIII) zugeteilt ist. Anfangs als geselliger Schüler dargestellt, äußert er häufig Interesse daran, romantische Beziehungen zu verfolgen, und schlägt Ausflüge vor, um Mädchen kennenzulernen. Er betrachtet Kazuki Makabe als Rivalen und fordert ihn oft im Sparring und anderen Aktivitäten heraus, obwohl Kazuki diese Rivalität nicht erwidert. Kenji durchläuft eine obligatorische Fafner-Pilotenausbildung, nachdem er von der defensiven Organisation der Insel, Alvis, ausgewählt wurde.

Nach der Originalserie wechselt Kenji vom aktiven Piloten zu einer medizinischen und operativen Rolle innerhalb von Alvis. In *Exodus* arbeitet er im medizinischen Büro, überwacht die Gesundheit neuer Piloten, sorgt für Nachuntersuchungen nach Gefechten und erinnert Kollegen an Termine. Er pflegt eine enge Beziehung zu Sakura Kaname, die er schließlich heiratet (was dazu führt, dass sie den Namen Kondou annimmt). Ihre gemeinsamen Mahlzeiten spiegeln gegenseitige Fürsorge und Kenjis Zufriedenheit wider. Er arbeitet auch mit Maya Toomi in der medizinischen Abteilung zusammen und zeigt eine professionelle Kameradschaft, die manchmal von humorvollen Meinungsverschiedenheiten über Arbeitsplatzetikette geprägt ist.

Kenjis Verantwortung erweitert sich in *The Beyond* erheblich. Er bedient das kritische Siegfried-System und koordiniert Fafner-Einheiten während des Kampfes. Während der Fünften Operation Azure überwacht er das Schlachtfeld, während er ein persönliches Video seiner Frau und seines Sohnes betrachtet, was seine anhaltenden familiären Bindungen verdeutlicht. Als der gegnerische Festum durch die Pilotin Rina Nishio in das System eindringt, werden Kenji und andere assimiliert, was dazu führt, dass ihre physischen Formen zerfallen. Um dies zu stoppen, verabreicht er sich drei Activion-Röhren direkt in den Hals. Diese Aktion erzwingt die Trennung des Systems, stoppt die Assimilation für die meisten Mitarbeiter, verursacht jedoch starke Blutungen aus seinen Augen, seiner Nase und seinem Mund. Trotz seiner Verletzungen erkennt er Rinas Absicht, sich zu opfern, und fordert sie dringend auf, damit aufzuhören, kann ihr Schicksal jedoch nicht verhindern.

Im Laufe seiner Entwicklung wandelt sich Kenji von einem unbeschwerten Schüler zu einem hingebungsvollen Beschützer, der die Sicherheit der Gemeinschaft und seiner Lieben über sein eigenes Wohl stellt. Seine Rollen wechseln vom Frontpiloten zu strategischer Unterstützung und medizinischer Überwachung, gipfelnd in seinen entscheidenden und opferbereiten Aktionen während *The Beyond*.

Kenji Kondo