Mithos Yggdrasill, ursprünglich als Mithos der Held bekannt, lebte über 4.000 Jahre vor der Haupthandlung während des uralten Kharlan-Krieges. Als Halbelf in Heimdall geboren, erlebten er und seine Schwester Martel schwere Diskriminierung und wurden schließlich aus ihrer Heimat vertrieben. Später schlossen sie sich dem menschlichen Ritter Kratos Aurion und dem Halbelfen Yuan Ka-Fai an und bildeten die Vier Seraphim. Gemeinsam kämpften sie, um den Krieg zu beenden und Frieden zwischen Menschen, Elfen und Halbelfen zu schaffen.

Sein Ideal war die Beseitigung von Diskriminierung durch Einheit. Mithos schloss Pakte mit Beschwörungsgeistern und erhielt das Ewige Schwert von Origin, ihrem König. Mit seiner Kraft spaltete er die Welt in zwei parallele Dimensionen – Sylvarant und Tethe'alla –, um den Fortschritt der Magitechnologie zu stoppen, der den Konflikt durch den Verbrauch von Mana angeheizt hatte. Diese Tat schuf ein System, in dem die beiden Welten um begrenztes Mana konkurrierten, was den technologischen Fortschritt aufhielt.

Der Mord an Martel durch einen Menschen wurde Mithos' entscheidender Moment. Er missdeutete ihren sterblichen Wunsch nach einer Welt ohne Diskriminierung als einen Aufruf, die Verfolgung von Halbelfen zu beenden. Dieses Trauma, verstärkt durch seine Desillusionierung, zerstörte seine ursprünglichen Ideale. Unter dem Namen Yggdrasill gründete er Cruxis, das sich der Einführung eines "Zeitalters der Leblosen Wesen" widmete. Durch das Einpflanzen von Cruxis-Kristallen in Halbelfen verwandelte er sie in unsterbliche, emotionslose Engel, da er glaubte, erzwungene Gleichheit würde Diskriminierung beseitigen.

Um Martel wiederzubeleben, manipulierte Yggdrasill über Jahrtausende hinweg sorgfältig Blutlinien in beiden Welten, um ein Gefäß zu finden, das ihrer Mana-Signatur entsprach. Er gründete die Kirche Martels, vergötterte seine Schwester und positionierte sich als ihr oberster Führer. Zu seinen Methoden gehörten die Aufsicht über die Desianer, die Menschenfarmen betrieben, um Exspheres zu ernten, und die Inszenierung der Reise der Regeneration für aufeinanderfolgende Auserwählte.

Während der Ereignisse der Geschichte infiltrierte Yggdrasill Lloyds Gruppe, verkleidet als ein überlebendes Kind aus dem zerstörten Dorf Ozette. Er freundete sich mit Genis Sage an, schenkte ihm Panflöten, um die Gruppe zu überwachen. Obwohl kurzzeitig Zweifel aufkamen, verhärtete sich seine Entschlossenheit letztlich. Später offenbarte er seine Engelsgestalt im Turm der Erlösung, rettete Genis und enthüllte seine wahre Identität.

Sein Plan gipfelte darin, Martels Bewusstsein durch Colette Brunel, die Auserwählte von Sylvarant, zu kanalisieren. Bei ihrem Erwachen verurteilte Martel seine Gräueltaten und lehnte seine Vision ab. Unfähig, ihre Ablehnung zu akzeptieren, griff Yggdrasill die Gruppe wütend an. Nach der Zerstörung seines Körpers verblieb sein Geist in seinem Cruxis-Kristall, den Genis heimlich behielt.

Yggdrasill besaß dann einen von Lloyds Verbündeten und floh nach Derris-Kharlan, um den Himmelskörper von der Welt zu trennen und eine neue für sich und Martel zu erschaffen. Er versuchte, die Gruppenmitglieder zu überreden, sich ihm anzuschließen, wurde jedoch einstimmig abgelehnt. In der finalen Konfrontation in seinem Schloss wurde er besiegt. Ohne Reue erklärte er, er würde seine Taten bei Gelegenheit wiederholen. Lloyd zerstörte seinen Cruxis-Kristall und beendete seine Existenz.

In späteren Ereignissen bezog sich Lloyd auf Mithos als Teil des Weltenbaums geworden.

Mithos Yggdrasill