Yugi Muto entsperrt das uralte Millennium-Puzzle und befreit den Geist des Pharaos Atem. Diese Entität, genannt Yami Yugi, manifestiert sich in Yugis Körper während Krisen, um ihn und seine Freunde durch Schattenspiele zu schützen, die Strafurteile erzwingen. Anfangs eingeschüchtert, entwickelt Yugi tiefes Vertrauen in den Geist und überlässt ihm freiwillig die Kontrolle, wenn nötig. Yami Yugi projiziert eine reifere Statur als Yugi – größer, mit schärferen Augen und tieferer Stimme – behält aber Yugis Gesichtsstruktur und dreifarbige Haare. Seine Kleidung adaptiert Yugis Domino-High-Uniform mit dunkleren Tönen, Ankh-Manschettenknöpfen und dem Millennium-Puzzle-Anhänger.

Yami Yugi vereint strategisches Genie mit unerschütterlicher Ethik. Er verhängte einst brutale Strafen, fand aber durch Yugis Einfluss zur Mitgefühlt und schätzt Freundschaft und Güte. Sein Stolz verleitet ihn gelegentlich zu rücksichtslosen Aktionen, wie dem Einsatz des zerstörerischen Siegels des Orichalcos, um Niederlagen zu vermeiden, was schwerwiegende Folgen hat. Trotz seiner antiken Herkunft beherrscht er moderne Technologie sofort, bedient Duel-Disks und Hologramme mühelos. Er kommuniziert innerlich mit Yugi, nennt ihn „Partner“ (aibou) oder „anderes Ich“.

In *Yu-Gi-Oh! 3D: Bonds Beyond Time* – angesiedelt nach Battle City, aber vor Waking the Dragons – besuchen Yugi und Yami Yugi ein Duell-Event von Maximillion Pegasus zusammen mit Yugis Großvater Solomon Muto. Der Zeit-Schurke Paradox greift mit korrumpierten Zukunftsmons wie „Stardust Dragon“ an, tötet Pegasus und Solomon. Yugi überlebt allein, bis der Crimson Dragon die Zeit 30 Minuten zurückspult, wo er die Zeitreisenden Jaden Yuki und Yusei Fudo trifft. Als er von Paradox‘ Plan erfährt, die Geschichte von Duel Monsters zu löschen und ihre Zeitlinien zu vernichten, verbündet sich Yugi mit ihnen und übergibt Yami Yugi die Kontrolle für ein 3-gegen-1-Duell gegen Paradox.

Yami Yugi koordiniert mit Jaden und Yusei, vereint ihre Signature-Monster („Dark Magician“, „Elemental HERO Neos“ und „Stardust Dragon“), um Paradox‘ „Malefic“-Truppen zu zerschlagen. Diese Synergie zeigt Yami Yugis taktische Flexibilität und Führung, vereint sein Fachwissen mit Jadens Fusions-Taktiken und Yuseis Synchro-Beschwörungen. Ihr Sieg heilt die Zeitlinien, belebt Pegasus wieder und bewahrt das Erbe von Duel Monsters. Yugi übernimmt danach wieder die Kontrolle, setzt die Zeitlinie mit Solomon und Pegasus lebendig zurück.

Yugi Muto/Yami Yugi