Skywarp, ein maximaler Luftkampfausbilder, der von Cybertron entsandt wurde, verstärkt Lio Convoys Truppen auf Gaia mit Expertise in Lufttaktiken und elektronischen Innovationen. Er verwandelt sich in einen Weißkopfseeadler mit federbelasteten „Himmelsraketen“-Flügelstartern und verborgenen „Flügelkaliber“-Federschwertern für den Nahkampf, während er Überschallknall erzeugt, um Gelände zu räumen.

Zusammen mit Santon liefert er entscheidende Informationen über den künstlichen Planeten Nemesis und Galvatrons Plan, die instabile Angolmois-Energie zu weaponisieren. Sie treffen auf Lio Junior, einen wilden Jungtier, der aus Lio Convoys dupliziertem Energon-Matrix geboren wurde. Während ihres ersten Kampfes gegen Galvatron initiieren Skywarp und Santon eine erzwungene Fusion mit Lio Junior und bilden den Kombiner Magnaboss, um die unberechenbaren Energien des Jungtiers zu kanalisieren.

Als Magnaboss fungiert Skywarp als Kopfschmuck, Brustpanzer und Rückenkomponente. Diese Form erweist sich als entscheidend, um Gigastorm abzuwehren und die Cyborg-Bestien Hellscream und Max-B zu bekämpfen. Die Spannungen mit Lio Junior eskalieren aufgrund von dessen Impulsivität und Selbstdarstellung. Während einer Mission für einen Teleportationsschlossschlüssel weigern sich Skywarp und Santon zu kombinieren, was indirekt zur Verletzung von Tasmania Kid führt – eine Belastung für ihre Beziehung, bis sie sich während Lio Juniors kurzem Überlaufen zu den Predacons versöhnen.

Ein ausgezeichneter Pädagoge, mentoriert Skywarp junge Maximals, hat aber Schwierigkeiten mit Lio Juniors Rebellionsgeist. Er greift wiederholt ein, um dessen Leichtsinn zu stoppen, wie etwa Versuche, in Angolmois-Energiebecken zu tauchen. Als korrumpierte Angolmois-Energie Lio Junior dazu treibt, Lio Convoy anzugreifen, versuchen Skywarp und Santon eine weitere erzwungene Fusion, um ihn zu bändigen, doch Lio Convoy löst die Krise.

Im Nemesis-Konflikt stabilisiert Skywarp Angolmois-Energie-Geysire, verteidigt Geschützkanonen, die auf Nemesis zielen, und hilft beim Start des Raumschiffs Yukikaze in Richtung des künstlichen Planeten. Er bekämpft den Seacon Scylla in der Luft und bildet später Magnaboss gegen den kombinierten God Neptune. Auf Nemesis bietet er defensive Unterstützung während des Eindringens in den Planetenkern.

Skywarp entwickelt sich von einem strengen Ausbilder zu einem standhaften Mentor für Lio Junior. Trotz anfänglicher Reibung festigt sich ihre Partnerschaft durch gemeinsame Kämpfe und gelöste ideologische Konflikte, gipfelnd in vereinten Bemühungen, Galvatron zu vereiteln.

Skywarp