Heero Yuy, manchmal auch als Heero Yui bezeichnet, wurde in den 170er Jahren des After Colony (A.C.) von den OZ-Agenten Aoi Clark und Odin Lowe geboren. Nachdem Odin Lowe den pazifistischen Anführer Heero Yuy ermordet hatte und ihre Beziehung endete, lebte der Junge bei seiner Mutter und seinem Stiefvater Seis Clark, bis diese starben. Odin Lowe übernahm anschließend die Vormundschaft und trainierte ihn in Überlebens- und Kampftechniken. Auf der Kolonie L3-X18999 im Jahr A.C. 188 erlebte der Junge während eines Attentatsauftrags Odin Lowes Tod; dessen letzte Worte forderten ihn auf, „seinen Emotionen zu folgen“, und erklärten, „ein einziger törichter Mensch könne die Welt verändern“ – eine Philosophie, die für seine Zukunft prägend wurde.

Von Dr. J in den Kolonien treibend entdeckt, unterzog er sich genetischer Manipulation und hartem Training, das seine körperliche Kontrolle, Disziplin und sein logisches Denken verbesserte, um ihn zu einem außergewöhnlichen Operativen auszubilden, der in Nahkampf, Hacking und Mobile-Suit-Pilotenkunst bewandert war. Während einer Mission im Jahr A.C. 194, bei der er eine Allianzbasis zerstörte, tötete er versehentlich ein junges Mädchen und ihren Hund – ein Ereignis, das tiefe Selbstverachtung und Reue in ihm auslöste. Dekim Barton befahl daraufhin Dr. J, seine Emotionen zu unterdrücken, um eine effektivere Waffe zu schmieden, obwohl das Ausmaß dieser Umerziehung unklar bleibt.

Im Jahr A.C. 195 wurde er ausgewählt, um den Wing Gundam für die Operation Meteor zu pilotieren. Dr. J gab ihm den Codenamen „Heero Yuy“ als Hommage an den ermordeten Anführer. Er lehnte Dekim Bartons genozidalen Plan ab, eine Kolonie auf die Erde stürzen zu lassen, und zielte stattdessen nur auf OZ-Militäreinrichtungen. Anfangs kalt, stoisch und missionsbesessen traf er häufig selbstmörderische Entscheidungen, wie die Aktivierung der Selbstzerstörung seines Fluganzugs nach einem Absturz auf der Erde. Wiederholt drohte er Relena Darlian – die seine Identität entdeckt hatte – mit dem Tod, um sie von der Gefahr fernzuhalten, rettete sie jedoch mehrmals, als OZ sie ins Visier nahm.

Während des Konflikts knüpfte er widerwillig Bindungen zu anderen Gundam-Piloten, insbesondere zu Duo Maxwell, und erkannte allmählich seine unterdrückten Emotionen an. Die Nutzung des ZERO-Systems, das sein Bewusstsein und seine Kampffähigkeiten verstärkte, zwang ihn, psychologische Traumata und philosophische Widersprüche zu konfrontieren. Obwohl er erklärte, „Frieden sei nur eine Folge des Krieges“, entwickelten sich seine Handlungen dahin, Zivilisten zu schützen und sich Relenas pazifistischen Idealen anzunähern.

Im Endless-Waltz-Konflikt (A.C. 196) setzte er sich mit seiner anhaltenden Schuld über den Tod des Mädchens auseinander und lehnte Gundams als Kriegswerkzeuge ab. Nach der Vereitelung von Mariemaia Khushrenadas Rebellion schickte er den Wing Gundam Zero zusammen mit anderen Gundams in die Sonne, als Symbol für sein Bekenntnis zum Frieden. Die Fortsetzung Frozen Teardrop enthüllt, dass er Jahrzehnte später kryogenisch konserviert wurde und Relena Darlian schließlich einen Heiratsantrag machte. Im Epilog lebte er friedlich mit ihr auf dem Mars und sprach über Ehe und Familie.

Heero Yui