Koji Takahashi leitet Branch, eine geheime Abteilung der A.D. Police, die außerhalb standardmäßiger Protokolle operiert, um Verbrechen durch entgleiste Androiden namens Boomers zu untersuchen. Seine Freundschaft aus Collegezeiten mit Basil "Buzz" Nikvest führte dazu, dass er Buzz nach einem versehentlichen Schussvorfall in Branch rekrutierte, wodurch ihre professionelle Dynamik innerhalb der Einheit geprägt wurde.

Ursprünglich prinzipientreu, zerfällt Takahashis Integrität unter Karrieredruck und den moralisch zweifelhaften Anforderungen ihrer Arbeit. Die Erzählung markiert seinen ethischen Verfall und deutet an, dass er nicht mehr der "saubere" Mann von einst ist, was auf seine Beteiligung an fragwürdigen Aktionen hindeutet.

Fünf Jahre nach den Ereignissen des zweiten OVA verschwindet Takahashi auf mysteriöse Weise. Sein Verschwinden löst Branchs Untersuchung einer Welle von Anti-Boomer-Terrorismus aus, die eine Verschwörung zur Destabilisierung der Mensch-Boomer-Beziehungen aufdeckt. Die Ermittlungen deuten darauf hin, dass Takahashi entweder Ziel oder Beteiligter des Komplotts ist.

Takahashi