Proto ist ein bioroidisches Mitglied der Sektion 9 für öffentliche Sicherheit, das in der zweiten Staffel eingeführt wird. Als biologischer Android besitzt Proto einen Körper, der organische Elemente enthält, obwohl das Ausmaß und die Natur dieser biologischen Komponenten nicht detailliert beschrieben werden. Ursprünglich dient er als Wartungstechniker für die Tachikoma-Denkmaschinen und kümmert sich um deren Instandhaltung und operative Unterstützung. Seine Bezeichnung als "Prototyp" unterstreicht seinen experimentellen Status innerhalb der Einheit.

Protos Aufgaben gehen über technische Pflichten hinaus und umfassen auch die Rolle als Chauffeur und de facto Leibwächter von Chef Daisuke Aramaki. Während der Dejima-Krise – die einen Flüchtlingsaufstand und einen Regierungsumsturz beinhaltet – spielt Proto eine entscheidende Rolle in Aramakis Bemühungen, Premierministerin Yoko Kayabuki aus ihrem Hausarrest zu befreien. Er greift auf das Netzwerk zu, um mit den Tachikoma-Einheiten zu kommunizieren und Gebäudepläne sowie Echtzeit-Informationen für den Einsatz der Sektion 9 zu beschaffen. Dies ermöglicht es dem Team, die Premierministerin zu lokalisieren, bevor eine Angriffsbarriere Proto außer Gefecht setzt.

Der Charakter taucht im Film *Solid State Society* wieder auf, der zwei Jahre nach dem Dejima-Vorfall spielt. Proto wird in der standardmäßigen schwarzen Uniform der Sektion 9 und mit einer Seitenwaffe dargestellt, was seinen Übergang zu Feldeinsätzen und formalisierten Kampfaufgaben verdeutlicht. Diskussionen unter Fans und Analysten spekulieren, ob Proto über einen "Ghost" verfügt – was im Kontext der Serie Bewusstsein bedeutet. Argumente ziehen Parallelen zu den Tachikomas, die Selbstbewusstsein ohne biologische Gehirne entwickelten, obwohl es keine offizielle Bestätigung in den Medien gibt. Protos Ursprünge lassen sich auf den Manga *Ghost in the Shell 1.5: Human-Error Processor* zurückverfolgen, in dem er als wiederkehrende Figur auftritt.

Proto