Koji Onishi (japanischer Name: Yuki Onishi, 大西勇気) erlebt ein lebensveränderndes Ereignis, als Predacons seinen Vater, einen Wissenschaftler, während eines Symposiums in New York entführen. Dies führt dazu, dass er Optimus Prime im Metro Park trifft, wo der Anführer der Autobots seine cybertronische Herkunft offenbart. Optimus bringt Koji über den Global Space Bridge nach New York, doch sie kommen zu spät, um die Entführung zu verhindern.

Koji wird daraufhin regelmäßiger Gast im unterirdischen Stützpunkt der Autobots und dient als ihr kultureller Botschafter, um die menschliche Gesellschaft zu interpretieren. Er entwickelt eine Bindung zur sentienten KI T-AI, deren Hologramm er zunächst für physisch hält. Seine strategischen Einfälle unterstützen mehrere Missionen: Er schlägt die stratosphärische Entsorgung eines Sprengsatzes über Metro City vor, übermittelt Kommunikation während einer Rettungsaktion im Hochgeschwindigkeitszug und warnt die Autobots vor Predacon-Aktivitäten an Orten wie der Höhle des Drachen und dem Sherman Dam. Wissen aus Kindheitsreisen hilft ihm, Orte wie die Payuma-Ruinen und die Schwarze Pyramide zu navigieren, wo er einen versteckten Mikrochip in einem Familienfoto entdeckt, der die Sache der Autobots stärkt.

Die Gefangenschaft seines Vaters bleibt eine ständige Sorge. Koji lenkt sich ab, indem er mit seinem Freund Carl Fahrrad fährt oder Kraftwerke und Baseballspiele besucht, obwohl Predacon-Angriffe diese Ausflüge häufig unterbrechen. Seine Wahrnehmung des Predacon Sky-Byte ändert sich dramatisch, als Sky-Byte Dr. Onishi rettet und ihn in einem Behälter übergibt. Koji preist Sky-Byte daraufhin als Helden und schließt sich anderen Kindern an, um ein Autogramm des Predacons zu erhalten. Nach der Rettung hilft er bei der Bergung von O-Parts und besteht darauf, sich der Orb-of-Sigma-Mission anzuschließen, um T-AI zu schützen. Während dieses Einsatzes holt er den Orb von Megatron und bringt ihn zurück zur Basis. Später stoppt er den rasenden Fortress Maximus mit einem direkten Befehl.

Kojis Mutter erscheint kurz während der anfänglichen Entführung, wird danach jedoch nicht mehr erwähnt. Er pflegt Freundschaften mit Carl und Jenny und erlebt mit ihnen, wie Sky-Byte den CGA Tower verteidigt. Anfangs skeptisch gegenüber der Feindseligkeit von Ultra Magnus, erkundigt sich Koji später nach der Verbindung des Autobots zum Matrix of Leadership.

Yuuki Onishi