Dr. Cain ist ein älterer menschlicher Wissenschaftler und Archäologe. Im Jahr 21XX entdeckte er während einer archäologischen Expedition mit Fokus auf mesozoische Pflanzenwelt die Ruinen von Dr. Lights Labor. In diesen Ruinen fand er eine versiegelte Kapsel mit dem fortschrittlichen Roboter X. Nach der Durchsicht von Dr. Lights Notizen und der Bestätigung der Sicherheitsindikatoren der Kapsel öffnete er sie und erweckte X damit zum Leben. Als er Xs Fähigkeit zu eigenständigem Denken und Entscheiden erkannte, studierte Cain dessen Design, um eine neue Generation von Robotern namens Reploids zu erschaffen, wobei er den ersten am 22. November desselben Jahres fertigstellte.

Reploids wurden in Massenproduktion hergestellt und in die Gesellschaft integriert, wo sie verschiedene Aufgaben neben Menschen erfüllten. Allerdings konnte Cain Xs ausgeklügelte Diagnosesysteme nicht vollständig replizieren oder verstehen. Diese Einschränkung führte zu Fehlfunktionen bei einigen Reploids, die sie zu feindseligen "Mavericks" machte. Um dieser Bedrohung entgegenzuwirken, gründete Cain die Organisation Maverick Hunters und ernannte Sigma, seine fortschrittlichste Reploid-Kreation mit modernsten Schaltkreisdesigns, zu deren Anführer. Unter Cains Leitung erschuf Cain Labs auch Dr. Doppler und die Repliforce.

In "The Day of Σ", einem Animationsfilm, der vor den Hauptereignissen spielt, erscheint Cain deutlich gealtert und ist auf ein Lebenserhaltungssystem mit vier Schläuchen angewiesen, die aus seinem Rücken ragen. Während eines Gesprächs mit Sigma über die zunehmende Maverick-Aktivität und Xs Leistung auf dem Schlachtfeld beobachtet Cain Xs Zögern im Kampf. Er interpretiert dies nicht als Schwäche, sondern als Manifestation eines einzigartigen Potenzials – einer tiefen Empathie und ethischen Konflikte, die anderen Reploids fehlen. Cain fragt sich, ob dies neue Verbindungen zwischen Menschen und Robotern schaffen wird, und äußert Unsicherheit, ob es Hoffnung oder Chaos bringen wird. Er beklagt auch, dass seine durch Lebenserhaltung verlängerte Lebensspanne zu Ende geht, sodass er Xs vollständige Entwicklung nicht miterleben kann.

Während Sigmas Raketenangriff auf Abel City wird Cains Wohnsitz von einer Explosion erfasst, während er darüber nachdenkt, ob Reploids menschliche Arroganz darstellen. Sein Schicksal in dieser Kontinuität wird stark als Tod impliziert, obwohl es aufgrund der Einstellung der Remake-Serie keine offizielle Bestätigung gibt. In der Hauptzeitlinie der Spieleserie unterstützt Cain X und Zero bei mehreren Missionen. Er analysiert Maverick-Speicherchips, bietet taktische Unterstützung wie die Ortung von Feindbasen und arbeitet daran, Zero mit geborgenen Teilen zu rekonstruieren. Nach "Mega Man X4" wird Cain nicht mehr erwähnt oder gezeigt, was zu der Annahme führt, dass er sich zurückgezogen hat oder an Altersschwäche gestorben ist.

Andere Medien zeigen ihn anders. Der "Rockman X"-Manga zeigt Cain trotz seines Alters und Gehstocks mit größerer körperlicher Vitalität. Er begleitet X und Zero auf Missionen, zeigt ein kurzes Temperament und eine Vorliebe für Alkohol. Diese Hintergrundgeschichte enthüllt eine enge Freundschaft mit Dr. Doppler, einschließlich ihrer Zusammenarbeit an Projekten wie Maoh the Giant. Dopplers späterer Verrat und Selbstmord aufgrund von Sigmas Einfluss verursachen Cain erhebliche emotionale Belastung. Die Archie-Comics-Adaption zeigt seine Entdeckung von X und einen Vorfall, bei dem seine archäologische Arbeit gefährliche Mechaniloide in Dr. Wily's ehemaligem Labor versehentlich reaktiviert. "Rockman X The Novel: Irregulars Report" untersucht Cains frühe Kämpfe als Wissenschaftler, der verlorene Robotiktechnologie wiederbeleben wollte, bevor er X entdeckte, und beschreibt seine 17-jährige Analyse von X vor der Aktivierung sowie seine Entwicklung von "Energy Crystals" basierend auf Lights Forschung.

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