Tony Stark/Iron Man dient als Mentor für genetisch modifizierte Teenager in *Marvel Future Avengers*. Als er das "Smaragd-Regen-Projekt" von Hydra erforscht und der Hydra-Flüchtling Makoto im Avengers Tower auftaucht, misstraut Stark ihm zunächst, erklärt sich aber bereit, die Avengers bei der Rettung von Makotos Freunden anzuführen, im Austausch für den Standort der Hydra-Basis. Während des Überfalls bekämpft Stark Red Skull in einer Nanomaschinen-Rüstung. Als er den Fernsteuerungsmechanismus der Rüstung erkennt, dringen Stark und Makoto in die Systeme der Anlage ein, um ihn zu deaktivieren, was den Avengers den Sieg über Red Skull ermöglicht.

Nach der Rettung der Teenager und dem scheinbaren Tod von Bruno beteiligt sich Stark an der Überstellung von Red Skull ins Raft-Gefängnis. Als der Winter Soldier den Transport angreift, wehren die Avengers ihn mit Makotos Hilfe ab. Stark und die Avengers beschließen, die Jugendlichen auszubilden, nachdem sie deren Entschlossenheit, Helden zu werden, beobachtet und weitere Informationen über das Smaragd-Regen-Projekt gesammelt haben. Später entwickelt Stark spezielle "Visco-Handschuhe" für die Auszubildenden, die Waffeneinsatz und Kampfrüstung ermöglichen. Makoto nennt die Gruppe nach diesem Upgrade die "Future Avengers".

Stark unterstützt das Team während Trainingsmissionen. Als Thor sie nach K'un-L'un bringt, übernimmt Stark eine unterstützende Rolle, während Iron Fist das Training leitet. Die Gruppe trifft später auf Adi, der mit Schuldgefühlen wegen seiner vergangenen Taten für Hydra kämpft. Starks Vergangenheit als ehemaliger Waffenentwickler wird relevant, als Ezekiel Stane, der Rache für die Niederlage seines Vaters sucht, die Stadt angreift. Stark spricht offen über seine Fehler, betont aber, dass diese seine Gegenwart nicht definieren, und hilft Adi so, sich mit seiner eigenen Vergangenheit zu versöhnen. Anschließend besiegt Stark Stane und untermauert damit die Lektion der möglichen Erlösung.

Stark bietet den Future Avengers weiterhin taktische und technologische Unterstützung bei Missionen, darunter Ermittlungen zum Smaragd-Regen-Projekt und Konfrontationen mit Gegnern wie Ares und Enchantress, wobei er stets seine Erfahrungen nutzt, um die nächste Generation von Helden anzuleiten.

Tony Stark/Ironman