Zero ist der Protagonist im postapokalyptischen dystopischen Tokio (AD 2917), wo dämonische Invasionen die Menschheit an den Rand der Auslöschung treiben. Er ist das erste Subjekt und Prototyp des "Killer-Projekts" des Ragnarok-Instituts, das darauf abzielt, genetisch verbesserte Supersoldaten, genannt "Killer-Prinzen und -Prinzessinnen", zu erschaffen. Diese Krieger führen spezialisierte Waffen, um die Dämonen zu bekämpfen. Seine Bezeichnung "Zero" markiert seinen Status als grundlegendes Subjekt des Programms.

Durch brutale genetische Mutationsexperimente geformt, erlangt Zero verbesserte Kampffähigkeiten, die entscheidend für die Bewältigung der dämonischen Bedrohung sind, doch macht ihn dies auch extrem anfällig für die Kontrolle des Instituts. Seine Existenz ist geprägt vom Konflikt zwischen seiner konstruierten Bestimmung als Waffe und seinem Kampf, seine Menschlichkeit gegen die entmenschlichenden Protokolle des Instituts zu bewahren. Die Erzählung folgt seinen Bemühungen, sich in der menschlichen Welt zurechtzufinden, eine Lösung für die dämonische Krise zu finden und gleichzeitig mit den ethischen und existenziellen Folgen seiner Erschaffung zu ringen.

Das Anime-Konzeptfilm zeigt Zero, wie er aktiv gegen die Autorität des Ragnarok-Instituts rebelliert. Dieser Widerstand wird durch seine Weigerung angetrieben, auf ein bloßes Instrument reduziert zu werden, insbesondere als er die Behandlung eines anderen Subjekts durch das Institut miterlebt – einer "Killer-Prinzessin", die mit einer legendären Waffe verbunden ist. Ihre gemeinsame Erfahrung der Ausbeutung wird zum Katalysator für seinen Aufstand. Seine Entwicklung ist geprägt von der Ablehnung seiner Schöpfer und seines vorbestimmten Schicksals als entbehrliche Militärressource, auch wenn die langfristigen Folgen seines Wegs unerforscht bleiben.

Zero