Satoshi, ein hingebungsvoller Pokémon-Trainer, begibt sich auf eine Mission, um das mystische Pokémon Manaphy zu beschützen und den alten Unterwasserpalast Samiya wiederzubeleben. Zusammen mit seinen Begleitern trifft er auf die Marina-Gruppe – eine Familie von aquatischen Performern, die sich auf Wasser-Pokémon spezialisiert hat – und Jackie, einen erfahrenen Pokémon-Ranger, der damit beauftragt ist, Manaphys Ei zu seinem bestimmten Heiligtum zu bringen. Als das Ei unter der Obhut von Satoshis Freundin May schlüpft, entwickelt Manaphy eine untrennbare Bindung zu ihr.

Mit der Aufgabe, Phantom, einen skrupellosen Piraten, der Manaphys Macht ausnutzen will, um die Meereskrone – ein heiliges Artefakt in Samiya – an sich zu reißen, zu vereiteln, entwickelt Satoshi Strategien, um seinen Gegner auszumanövrieren. Nachdem Phantom den Tempel sabotiert und eine katastrophale Flut ausgelöst hat, eilt Satoshi, um die verstreuten Juwelen der Meereskrone neu auszurichten. In einer einstürzenden Kammer sichert er das letzte Juwel, stellt die Sicherheit von May, Pikachu und Manaphy in einer Luftkapsel sicher und stürzt sich dann zurück in die Gefahr, um den Tempel zu stabilisieren.

Während Samiya aufsteigt, verschwindet Satoshi kurzzeitig im Chaos, taucht aber wieder auf, geladen mit der Energie der Meereskrone. Mit dieser neu gewonnenen Kraft konfrontiert er Phantom, befreit Manaphy und trägt zur entscheidenden Niederlage des Piraten bei. Seine Bemühungen ermöglichen Manaphys Wiedervereinigung mit Samiya und unterstreichen Satoshis unerschütterliche Entschlossenheit und Selbstlosigkeit beim Schutz seiner Verbündeten und legendären Pokémon.

Satoshi