Kojiro, ein junger Ninja des legendären Fūma-Clans, bewahrt das historische Bündnis seines Clans mit der Hojo-Familie, das bis in die Sengoku-Zeit zurückreicht. In ihrem abgeschiedenen Bergdorf lebend, wird er entsandt, um die Hakuo-Akademie zu beschützen, eine prestigeträchtige Institution, die aufgrund aggressiver Schülerabwerbung durch den rivalisierenden Seishikan im Niedergang begriffen ist. Unter der kommissarischen Leiterin Himeko Hojo, der Enkelin des vorherigen Schulleiters, entfacht seine Mission einen jahrhundertealten Konflikt neu, als Seishikan den rivalisierenden Yasha-Clan anheuert und die Feindseligkeiten zwischen den Ninja-Fraktionen wiederaufleben lässt.

Mit jugendlicher Begeisterung und Naivität betritt Kojiro die moderne Welt und entwickelt sofort eine enge Bindung zu Himeko Hojo, die ihm emotionalen Halt in seinen Kämpfen bietet. Seine Kampftechnik konzentriert sich auf ein Holzschwert (Bokken), das trotz seines Materials feste Gegenstände und Fleisch durchtrennen kann und dabei die Gesetze der Physik ignoriert. Diese Waffe verkörpert sein traditionelles Ninja-Erbe und seine außergewöhnliche Schwertkunst.

Als die Auseinandersetzungen zu einem großangelegten Ninja-Krieg eskalieren, erhalten ihn weitere Fūma-Mitglieder an der Hakuo-Akademie Verstärkung. Er zeigt tiefe Loyalität gegenüber seinen Kameraden und seinem Clan und hält strikt am "Shinobi-Gesetz" fest. Doch die Brutalität des Krieges – insbesondere der Tod von Clanmitgliedern – zwingt ihn, die menschlichen Kosten zu erkennen, was innere Reflexion und Konflikte auslöst. Seine Mitmenschlichkeit zeigt sich in seinen Interaktionen mit Erina Asuka, der hospitalisierten jüngeren Schwester seines Rivalen Musashi Asuka, die er als Unschuldige in dieser Fehde erkennt.

Nach dem Konflikt mit dem Yasha-Clan wird Kojiro in den "Heiligen Schwertkrieg" hineingezogen, einen kosmischen Kampf zwischen den Mächten von Cosmo und Chaos, der sich über Jahrtausende erstreckt. An der Seite von Verbündeten, darunter sein ehemaliger Rivale Musashi Asuka und der Fūma-Krieger Ryoma, wird er zum "Cosmo-Krieger". Dieser Krieg dreht sich um zehn heilige Schwerter, die Weltherrschaft verleihen, wobei Fuurin Kazan und Ougonken als entscheidende Klingen gelten. Mit diesen Waffen bekämpft er Verkörperungen kosmischer Schicksale und stellt sich zyklischer Wiedergeburt und Karma gemäß dem buddhistischen Saṃsāra.

Nach dem Heiligen Schwertkrieg bricht ein Putsch innerhalb des Fūma-Clans aus. Der "Neue Fūma-Clan" (Shinsei Fuma) lehnt die Tradition ab und brandmarkt Traditionalisten wie Kojiro als Feinde. Während des "Fūma-Aufstands" verteidigt er das Erbe des Clans gegen internen Verrat, wobei er sich Gegnern wie dem geisteskontrollierenden Shimon stellen muss, während er versucht, die zerrissene Linie wieder zu vereinen.

Spätere Erweiterungen der Handlung – der Manga-Nachfolger "Yagyū Ansatsuchō" und das Prequel "Jou no Maki" – beleuchten Kojiros Vermächtnis und frühere Abenteuer. Diese Geschichten festigen seine Rolle als zentrale Figur des Fūma-Clans und unterstreichen seine unerschütterlichen Kämpfe gegen übernatürliche Bedrohungen sowie seine Hingabe zu Kameraden und Prinzipien über Wiedergeburt und Konflikte hinweg.

Kojiro