Yûsuke Ninomiya, bekannt als Yû, überlebte als Säugling einen Flugzeugabsturz, der das Leben seiner Eltern forderte und ihn querschnittsgelähmt zurückließ, wodurch er an einen Rollstuhl gefesselt war. Er wuchs in einem Tokioter Krankenhaus auf, wo er einem alten Mann begegnete, der behauptete, Welten durchqueren und Magie wirken zu können. Später wurde er von einem Blumenladenbesitzer adoptiert und lebte mit seiner Adoptivschwester Saki Mishima zusammen.

Als Kind griff Yû ein, als Haruto Ichihara (Haru) von einem Hund angegriffen wurde, und lenkte das Tier ab, indem er einen Stein auf sich selbst warf, damit beide fliehen konnten. Diese Tat schmiedete eine unzerbrechliche Bindung. In der Highschool unterstützte Yû Harus Basketballstrategien, während beide Gefühle für die Mitschülerin Kotona Takashina hegten. Haru ging schließlich mit ihr aus. Das Trio verbrachte Zeit miteinander, obwohl Yû manchmal aufgrund unzugänglicher Orte ausgeschlossen wurde.

Yû erhielt einen panischen Anruf von Kotona, die verfolgt wurde. Er fand sie gerade, als ein Angreifer sie mit einem mystischen Dolch erstach. Als Haru versuchte, sie wegzutragen, entgingen alle drei knapp einem Verkehrsunfall und wurden in die parallele Fantasiewelt Ni no Kuni transportiert. Dort erlangte Yû die Fähigkeit zu gehen. Er und Haru entdeckten Prinzessin Astrid von Evermore, die Kotona ähnelte und identische Fluchmale trug. Yû entfernte einen manifestierten Dolch aus Astrid und heilte sie.

Yû erfuhr, dass Kotonas Leben in der realen Welt mit Astrids Leben in Ni no Kuni verbunden war. Als bei Kotona ein unheilbarer Tumor diagnostiziert wurde, beschloss Haru, Astrid zu töten, um sie zu retten. Yû lehnte diesen Plan ab und weigerte sich, Astrid zu opfern. Nach einer erneuten Konfrontation mit dem Attentäter wurde Yû in Ni no Kuni gefangen genommen und gezwungen, während der Invasion der Schwarzen Banner-Armee gegen Haru zu kämpfen. Ihr Duell brachte sie zurück in die reale Welt.

Yû erkannte, dass Sakis Leben mit Bertha Roam, einer gefangenen Ritterin in Ni no Kuni, verbunden war. Er und Haru retteten Saki vor dem Attentäter, der sich in ein Monster verwandelte. Zurück in Ni no Kuni entlarvten sie den wahren Antagonisten: Kronprinz Sedulus Astrum (als Minister Gnauss Wisden verkleidet). In der finalen Konfrontation fing Yû einen Angriff ab, der für Astrid bestimmt war, und erlitt tödliche Wunden. Ein alter Mann (der sich als Oliver aus einer anderen Zeitlinie entpuppte) erklärte Yû zum wahren Helden. Mit der Kraft des Göttlichen Avnaron und dem Schwert Mornstar half Yû, Sedulus zu besiegen.

Die Auflösung enthüllte, dass Yû ursprünglich aus Ni no Kuni stammte und nicht aus der realen Welt; seine Anwesenheit in Harus Welt war nur vorübergehend, um Haru Jahre zuvor vor dem Hundangriff zu retten. Nach der Schlacht entschied sich Yû, als Prinz von Evermore in Ni no Kuni zu bleiben und eine Beziehung mit Astrid einzugehen. Die Menschen in der realen Welt vergaßen seine Existenz, außer Haru, der ihre gemeinsamen Erinnerungen behielt. Yûs Persönlichkeit ist von strategischem Denken, Loyalität und moralischer Überzeugung geprägt, was oft im Kontrast zu Harus Impulsivität steht. Er zeigt durchweg Mut und beschützende Instinkte und weigert sich, andere zu opfern, ungeachtet persönlicher Konsequenzen.

Yû