Isami Kondo befehligt die Shinsengumi, die gegründet wurde, um Kyoto während der Bakumatsu-Zeit zu schützen. Als gebürtiger Edoer gründete er die Gruppe gemeinsam mit engen Gefährten wie Toshizo Hijikata, mit denen er eine lebenslange Bindung teilte, die in ihrer Jugend durch den gemeinsamen Wunsch, Krieger zu werden, trotz ihrer nicht-samuraiischen Herkunft entstand. Er pflegt eine tief väterliche Beziehung zu Souji Okita, den er nach dessen Verlassenheit zu einem beeindruckenden Kämpfer erzog.

Als Kommandant strahlt Kondo Wärme und Zugänglichkeit aus und behandelt seine Untergebenen mit Freundlichkeit und Lachen. Sein vertrauensvoller Charakter führt dazu, dass er leicht an das innere Gute in anderen glaubt, eine Eigenschaft, die Hijikata manchmal als naiv betrachtet. Trotz dieser wahrgenommenen Weichheit besitzt Kondo beträchtliche mentale und physische Stärke und übernimmt die volle Verantwortung für seine eigenen Handlungen und die seiner Männer. Sein gegenseitiger Respekt für die Kapitäne der Shinsengumi inspiriert deren unerschütterliche Loyalität. Typischerweise verlässt er sich bei strategischen Entscheidungen auf Hijikata, während er als Hauptrepräsentant und letzte Autorität der Organisation dient.

Kondo zeigt früh Mitgefühl, indem er Chizuru Yukimura erlaubt, bei den Shinsengumi zu bleiben, während sie nach ihrem vermissten Vater sucht, und dabei Bedenken über sensible Informationen übergeht. Er führt kritische Operationen persönlich an, darunter die Konfrontation mit den Choshu-Rebellen im Ikedaya Inn. Sein Vertrauen geht so weit, dass er sogar den ideologischen Gegner Kashitarou Itou in die Reihen einlädt, eine Entscheidung, die später dazu führt, dass Kondo persönlich Itou während dessen Attentats ablenken muss.

Nach Itous Tod erleidet Kondo eine lebensbedrohliche Schusswunde während eines Vergeltungsangriffs auf dem Rückweg von einer Shogunats-Sitzung; sein Insistieren auf eine minimale Eskorte trug zu seiner Verwundbarkeit bei. Während seiner Genesung neben Okita in Osaka informiert er später die Shinsengumi über die Abreise des Shoguns nach Edo.

Kondo erhält später einen prestigeträchtigen Hatamoto-Titel und ein Landgeschenk, das davon abhängt, dass die Shinsengumi die Kofu-Burg sichern. Diese Anerkennung weckt in ihm den Wunsch nach sozialer Bestätigung, was ihn dazu verleitet, den Sieg um jeden Preis zu priorisieren. Während der Schlacht ignoriert er zunächst die Sorgen über Verluste und besteht darauf, sie müssten „wie Männer kämpfen“ und fordert diejenigen heraus, die unsichere Kämpfe meiden. Der Anblick eines untergebenen, der in einer Explosion stirbt, verändert seine Perspektive und offenbart die Sinnlosigkeit weiteren Blutvergießens. Er befiehlt den Rückzug und versucht, sich opfernd zu sühnen, nur um aufzuhören, als Chizuru eingreift und ihn auffordert, die für ihn erbrachten Opfer zu ehren.

Angesichts überwältigender feindlicher Kräfte, die das Shinsengumi-Hauptquartier umzingeln, besteht Kondo darauf, als Köder zu agieren, um anderen die Flucht zu ermöglichen. Er plant, seinen Hatamoto-Status auszunutzen, indem er seine Einheit als Samurai darstellt, die einen hochrangigen Offiziellen schützen, in der Annahme, dass dies seine Hinrichtung verzögern wird. Er übergeht Hijikatas heftige Einwände, indem er seine Befehlsgewalt geltend macht und einen direkten Befehl erteilt – eine Abweichung von ihrer üblichen Zusammenarbeit. Seine letzten Worte an Hijikata drücken Bedauern darüber aus, ihn zu einem Rasetsu gemacht zu haben, und erkennen Hijikatas Bemühungen an, seinen Ruf aufzubauen. Nachdem er sichergestellt hat, dass Chizuru und andere geflohen sind, ergibt er sich. Spätere Rettungsversuche scheitern, was zu Kondos Enthauptung führt.

Rückblenden zeigen Kondo bei der Gründung der Rōshigumi (dem Vorläufer der Shinsengumi) mit Hijikata und Keisuke Sannan. Er verhandelt ein Bündnis mit dem unberechenbaren Kamo Serizawa und nutzt Serizawas politische Verbindungen trotz der Bedenken seiner Kameraden. Kondo unterwirft sich zunächst Serizawa und entschuldigt sich sogar überschwänglich, nachdem ein Buchungsfehler im Honjou Inn Serizawa dazu verleitet, ein Gebäude in Brand zu setzen. Hijikata ermahnt Kondo später für diese Unterwürfigkeit und erinnert ihn an ihren gleichberechtigten Status innerhalb der Gruppe.

Isami Kondo