Botchan, dessen echter Name ungenannt bleibt, wächst in Tokio ungestüm und widerspenstig auf. Seine Kindheit ist geprägt von häufigen Konflikten: Er springt vom zweiten Stock seiner Schule, prügelt sich mit Nachbarn und beschädigt Eigentum, was ihm den Ruf eines örtlichen Unruhestifters einbringt. Seine Eltern bevorzugen seinen fleißigen älteren Bruder, was Botchan emotional distanziert zurücklässt. Der einzige positive Einfluss ist Kiyo, die alte Hausangestellte der Familie, die ihm bedingungslose Zuneigung und moralische Führung bietet und ihn trotz seines Verhaltens mit außergewöhnlicher Güte betrachtet.

Nach dem Tod seiner Mutter und später seines Vaters liquidiert Botchans Bruder das Familienvermögen, gibt ihm 600 Yen und bricht den Kontakt ab. Botchan nutzt dieses Erbe, um in Tokio Physik zu studieren, und schließt das Studium ohne klare Berufsvorstellungen ab. Er nimmt eine Stelle als Mathematiklehrer in Matsuyama an, einer ländlichen Stadt auf der Insel Shikoku, was seine erste Erfahrung außerhalb Tokios markiert. Dieser Umzug versetzt ihn in eine ungewohnte Umgebung, die von traditionellen Bräuchen geprägt ist und sich von seiner städtischen Erziehung unterscheidet.

In Matsuyama prallen Botchans Geradlinigkeit und sein hitziges Temperament auf die örtliche Kultur. Er gibt Kollegen Spitznamen basierend auf ihren Eigenschaften: Der Schulleiter wird „Tanuki“ (Marderhund) wegen seiner Unentschlossenheit, der stellvertretende Schulleiter „Rothemd“ wegen seiner affektierten westlichen Kleidung und seines Elitismus, der Kunstlehrer „Nodaiko“ (Feldrettich) wegen seiner Speichelleckerei, der Englischlehrer „Uranari“ (unreifer Kürbis) wegen seiner melancholischen Art und der Mathematiklehrer „Stachelschwein“ wegen seiner direkten, gerechtigkeitsliebenden Persönlichkeit. Botchans Schüler quälen ihn mit Streichen wie Heuschrecken in seinem Bett und öffentlichem Spott, was seine Isolation verstärkt.

Anfängliche Naivität führt dazu, dass er Kollegen falsch einschätzt, doch allmählich erkennt er ihre moralische Haltung. Er durchschaut „Rothemd“ als manipulativ und heuchlerisch, der seine Autorität ausnutzt, um „Uranari“ zu versetzen und Rivalen zu schwächen, während „Stachelschwein“ Integrität verkörpert. Botchan verbündet sich mit „Stachelschwein“, um der Korruption entgegenzutreten. Dies gipfelt in einer Prügelei, in der sie „Rothemd“ und „Nodaiko“ auflauern, nachdem sie deren Verwicklung mit örtlichen Geishas aufdecken. Diese Trotzhandlung zeigt Botchans Einsatz für Gerechtigkeit.

Nach der Auseinandersetzung kündigt Botchan und kehrt nach Tokio zurück, wo er eine Anstellung als Straßenbahningenieur findet. Er richtet einen Haushalt mit Kiyo ein und würdigt ihre lebenslange Loyalität. Nach ihrem Tod an Lungenentzündung lässt er sie im Familiengrab bestatten und ehrt sie als seine einzige mütterliche Figur. Dieses Ende unterstreicht seine moralische Beständigkeit und Treue zu denen, die ihn unterstützt haben.

Botchans Entwicklung dreht sich darum, Heuchelei zu bewältigen, während er seine Grundwerte bewahrt. Seine Tokioter Identität, „Edokko“ genannt, schürt seine Verachtung für provinzielle Kleinlichkeit und elitistische Attitüden. Die Erzählung rahmt seine Reise als Kritik an der Oberflächlichkeit der westlichen Einflüsse in der Meiji-Ära und nutzt seine direkte Perspektive, um gesellschaftliche Missstände aufzudecken. Sein Wachstum zeigt sich darin, Kiyos ethische Lehren auf die Herausforderungen des Erwachsenenlebens anzuwenden, wobei er schließlich Aufrichtigkeit über Manipulation stellt.

Botchan