Die Mangaserie "The Hidden Dungeon Only I Can Enter" erzählt die Geschichte von Noir Stardia, einem jungen Mann aus einer verarmten Adelsfamilie, der in einer Welt lebt, in der Fähigkeiten und Magie den sozialen Status bestimmen. Noir besitzt die seltene Fähigkeit, verborgene Dungeons zu betreten, die für andere unzugänglich sind. Diese Dungeons sind gefährlich, bergen aber auch wertvolle Schätze und Möglichkeiten, neue Fähigkeiten zu erlernen.

Noirs Leben ändert sich, als er auf einen mysteriösen Dungeon stößt, der von einer mächtigen Kreatur namens Olivia bewacht wird. Olivia gewährt ihm Zugang zu einem einzigartigen System, das es ihm ermöglicht, Fähigkeiten durch den Einsatz von LP (Lebenspunkte) zu erwerben und zu verbessern. Diese LP können durch verschiedene Aktivitäten wie das Erfüllen von Aufgaben, das Sammeln von Erfahrungen oder sogar durch körperliche Zuneigung gewonnen werden.

Im Laufe der Geschichte nutzt Noir seine neu erworbenen Fähigkeiten, um sich in der Welt zu behaupten und seine Familie aus der Armut zu befreien. Dabei trifft er auf verschiedene Charaktere, darunter Emma Brightness, eine talentierte Magierin, die seine Vertraute und Unterstützerin wird, sowie Lola, eine mysteriöse Frau, die ebenfalls Zugang zu den verborgenen Dungeons hat. Zusammen mit seinen Verbündeten stellt sich Noir zahlreichen Herausforderungen, darunter mächtige Monster, intrigante Adlige und die Geheimnisse der Dungeons selbst.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Mischung aus Abenteuer, Kämpfen und zwischenmenschlichen Beziehungen, wobei Noir stets versucht, seine Fähigkeiten zu verbessern und seine Ziele zu erreichen. Die Serie kombiniert Elemente des Fantasy-Genres mit humorvollen und romantischen Untertönen, während sie die Entwicklung des Protagonisten und seiner Beziehungen zu den anderen Charakteren in den Vordergrund stellt.