"Kugutsu (Manga)" erzählt die Geschichte eines dystopischen Universums, in dem die Gesellschaft von mächtigen Puppenspielern beherrscht wird, die sogenannte Kugutsu kontrollieren. Diese Kugutsu sind lebendige Puppen, die durch die Fähigkeiten ihrer Meister zum Leben erweckt werden und sowohl als Werkzeuge als auch als Waffen eingesetzt werden können. Die Handlung konzentriert sich auf einen jungen Protagonisten, der in einer Welt aufwächst, in der die Kontrolle über Kugutsu den sozialen Status und die Machtverhältnisse bestimmt.

Der Protagonist, ein talentierter, aber unerfahrener Puppenspieler, strebt danach, die Geheimnisse der Kugutsu zu meistern und die Grenzen ihrer Fähigkeiten zu erkunden. Dabei wird er in einen Konflikt zwischen verschiedenen Fraktionen hineingezogen, die um die Vorherrschaft in dieser von Magie und Technologie geprägten Welt kämpfen. Die Handlung entwickelt sich durch politische Intrigen, Kämpfe zwischen rivalisierenden Puppenspielern und die allmähliche Enthüllung der wahren Natur der Kugutsu.

Ein zentrales Thema ist die Beziehung zwischen den Puppenspielern und ihren Kugutsu, die oft von Abhängigkeit, Manipulation und Loyalität geprägt ist. Die Kugutsu selbst werden nicht nur als Werkzeuge dargestellt, sondern besitzen eigene Persönlichkeiten und Emotionen, was die moralischen Dilemmata der Charaktere vertieft. Neben dem Protagonisten spielen mehrere Schlüsselcharaktere eine wichtige Rolle, darunter erfahrene Puppenspieler, die als Mentoren oder Gegner fungieren, sowie Kugutsu, die ihre eigenen Ziele verfolgen.

Die Handlung ist geprägt von einer Mischung aus Action, Drama und mystischen Elementen, wobei die Weltbuilding-Aspekte eine detaillierte und faszinierende Kulisse schaffen. Die Geschichte erkundet Themen wie Macht, Identität und die Grenzen zwischen Mensch und Maschine, während sie gleichzeitig eine spannende und oft unvorhersehbare Handlung bietet.