Die dritte Staffel von *Saint Seiya: Knights of the Zodiac* setzt die epische Reise der Bronze Saints fort, die im Auftrag der Göttin Athena gegen mächtige Gegner kämpfen. Nach den Ereignissen der vorherigen Staffeln, in denen die Saints den Silber- und Gold Saints gegenüberstanden, konzentriert sich die Handlung nun auf die Konfrontation mit den mächtigen Poseidon-Kriegern, die unter dem Kommando des Meeresgottes Poseidon stehen. Poseidon hat die Kontrolle über die Ozeane übernommen und plant, die Erde zu überfluten, um eine neue Weltordnung zu schaffen.

Die Bronze Saints – Seiya, Shiryu, Hyoga, Shun und Ikki – müssen erneut ihre Kräfte vereinen, um die Menschheit zu retten. Sie dringen in den Unterwasserpalast von Poseidon ein, der in sieben verschiedene Kammern unterteilt ist, die jeweils von einem mächtigen Marine General bewacht werden. Jeder dieser Generäle repräsentiert einen der sieben Meere und verfügt über einzigartige Fähigkeiten, die den Saints alles abverlangen. Die Kämpfe sind intensiv und strategisch, wobei jeder Bronze Saint seine individuellen Fähigkeiten und Cosmo-Kräfte einsetzt, um die Generäle zu besiegen.

Im Laufe der Staffel wird deutlich, dass Poseidons Wiedererwachen durch die Manipulation eines mysteriösen Charakters namens Julian Solo verursacht wurde, der sich als menschlicher Erbe des Meeresgottes entpuppt. Julian ist zunächst ein wohlwollender Charakter, wird jedoch von Poseidons Einfluss korrumpiert. Die Saints müssen nicht nur die Marine Generäle besiegen, sondern auch Julian davon überzeugen, seine wahre Natur zu erkennen und den Einfluss Poseidons abzuschütteln.

Höhepunkt der Staffel ist der finale Kampf im Inneren des Unterwasserpalastes, wo die Bronze Saints gegen Poseidon selbst antreten. Mit der Unterstützung von Athena, die ihre göttliche Rüstung trägt, gelingt es den Saints, Poseidons Pläne zu vereiteln und die Welt vor der Zerstörung zu bewahren. Die Staffel endet mit der Wiederherstellung des Friedens, wobei die Saints erneut ihre Entschlossenheit und ihren Mut unter Beweis stellen. Die Handlung legt den Grundstein für zukünftige Konflikte, während sie die Charakterentwicklung der Protagonisten und die komplexe Mythologie der Serie weiter vertieft.