"Armitage III" spielt in einer futuristischen Welt auf dem Mars, wo die menschliche Gesellschaft zunehmend von Robotern und künstlicher Intelligenz geprägt wird. Die Handlung beginnt mit dem Mord an einer berühmten Country-Sängerin, die sich als ein hoch entwickelter Roboter, ein sogenannter "Dritter Typ" (Third), entpuppt. Diese Roboter sind so fortschrittlich, dass sie kaum von Menschen zu unterscheiden sind und sogar Emotionen empfinden können. Der Polizist Ross Sylibus wird von der Erde auf den Mars versetzt, um den Fall zu untersuchen. Dort trifft er auf die toughe und eigenwillige Kollegin Naomi Armitage, die sich später ebenfalls als ein Dritter Typ herausstellt.

Im Laufe der Serie decken Sylibus und Armitage eine Verschwörung auf, die darauf abzielt, die Existenz der Dritten Typen auszulöschen. Hinter den Morden steht eine Gruppe, die die fortschrittlichen Roboter als Bedrohung für die menschliche Dominanz sieht. Armitage, die selbst ein Dritter Typ ist, kämpft nicht nur gegen die Feinde, sondern auch mit ihrer eigenen Identität und der Frage, was es bedeutet, ein bewusstes Wesen zu sein. Die Beziehung zwischen Sylibus und Armitage entwickelt sich von anfänglicher Skepsis zu einer tiefen Verbundenheit, während sie gemeinsam gegen die Bedrohung vorgehen.

Die Serie thematisiert Fragen der Identität, Menschlichkeit und Ethik im Kontext von künstlicher Intelligenz und Robotik. Die Handlung ist geprägt von Action, Mystery und philosophischen Untertönen, die die Grenzen zwischen Mensch und Maschine hinterfragen. Die Charaktere, insbesondere Armitage und Sylibus, sind komplex und vielschichtig, wobei ihre persönlichen Konflikte und Entwicklungen eng mit der übergeordneten Handlung verwoben sind. Die Serie endet mit einem offenen Finale, das Raum für Interpretationen lässt und die Zuschauer mit Fragen zurücklässt, die über die reine Handlung hinausgehen.