Die OVA "Hamtaro: Ham-Hams Ahoy!" handelt von den Abenteuern des kleinen Hamsters Hamtaro und seiner Freunde, den sogenannten Ham-Hams. Die Geschichte beginnt, als Hamtaro und seine Besitzerin Laura einen geheimnisvollen Brief erhalten, der sie zu einem alten Leuchtturm am Meer einlädt. Neugierig machen sich Hamtaro und die Ham-Hams auf den Weg, um das Rätsel zu lösen.

Am Leuchtturm angekommen, entdecken sie eine Schatzkarte, die auf eine verborgene Insel führt. Die Gruppe beschließt, die Insel zu erkunden, und baut sich aus verschiedenen Materialien ein kleines Boot, um dorthin zu gelangen. Während ihrer Reise begegnen sie neuen Freunden, darunter den freundlichen Seevögeln und einem einsamen Leuchtturmwärter, der ihnen bei ihrer Suche hilft.

Auf der Insel angekommen, stoßen die Ham-Hams auf eine Reihe von Herausforderungen, darunter natürliche Hindernisse und kleine Rätsel, die sie lösen müssen, um den Schatz zu finden. Dabei arbeiten sie als Team und zeigen, wie wichtig Freundschaft und Zusammenarbeit sind. Schließlich entdecken sie den Schatz, der nicht nur materielle Güter, sondern auch die Erkenntnis enthält, dass die wahre Belohnung in den gemeinsamen Erlebnissen und der gestärkten Freundschaft liegt.

Die Charaktere, darunter Hamtaro, Bijou, Oxnard, Boss und die anderen Ham-Hams, bleiben ihren bekannten Persönlichkeiten treu. Hamtaro ist mutig und neugierig, Bijou liebenswert und fürsorglich, Oxnard gutmütig und etwas ängstlich, während Boss der selbsternannte Anführer der Gruppe ist. Die OVA betont die Dynamik der Gruppe und ihre Fähigkeit, gemeinsam Probleme zu lösen, während sie gleichzeitig neue Umgebungen und Herausforderungen erkunden.