"Classroom of the Elite: Horikita (Manga)" ist eine Adaption der Light-Novel-Reihe "Youkoso Jitsuryoku Shijou Shugi no Kyoushitsu e" und konzentriert sich auf die Perspektive der Figur Suzune Horikita. Die Handlung spielt in der Koudo Ikusei Senior High School, einer Elite-Schule, die Schüler auf ihre zukünftige Karriere vorbereitet. Die Schule ist in Klassen unterteilt, die von A (die beste) bis D (die schlechteste) eingestuft werden. Die Schüler erhalten monatlich Punkte, die als Geld verwendet werden können, und ihre Leistungen beeinflussen den Status ihrer Klasse.

Suzune Horikita, eine Schülerin der Klasse D, ist eine intelligente und eigenständige Person, die sich zunächst von ihren Mitschülern distanziert. Sie strebt danach, in die Klasse A aufzusteigen, um ihre persönlichen Ziele zu erreichen. Im Laufe der Geschichte entwickelt sie eine komplexe Beziehung zu Kiyotaka Ayanokouji, einem ruhigen und mysteriösen Klassenkameraden, der sich absichtlich im Hintergrund hält. Ayanokouji besitzt jedoch ungewöhnliche Fähigkeiten und ein tiefes Verständnis für menschliches Verhalten, was ihn zu einem wichtigen Akteur in den Klassenkämpfen macht.

Die Handlung dreht sich um die Herausforderungen, die die Schüler bewältigen müssen, darunter Prüfungen, Wettbewerbe und soziale Konflikte. Die Schule setzt spezielle Tests ein, die nicht nur akademisches Wissen, sondern auch strategisches Denken und Teamarbeit erfordern. Horikita und ihre Klassenkameraden müssen lernen, zusammenzuarbeiten und ihre individuellen Stärken zu nutzen, um ihre Klasse voranzubringen. Dabei werden Themen wie Vertrauen, Rivalität und die Natur von Hierarchien und Machtstrukturen untersucht.

Neben Horikita und Ayanokouji spielen weitere Charaktere eine wichtige Rolle, darunter Kikyou Kushida, eine beliebte und scheinbar freundliche Schülerin, die jedoch ein dunkles Geheimnis verbirgt, und Ken Sudou, ein temperamentvoller Sportler, der oft in Konflikte gerät. Die Dynamik zwischen den Charakteren und ihre persönlichen Entwicklungen sind zentral für die Handlung.

Die Geschichte kombiniert Elemente von Psychologie, Strategie und Schuldrama, wobei die Schüler ständig vor moralische und ethische Dilemmata gestellt werden. Die Klassenkämpfe und die Bemühungen, in der strengen Hierarchie der Schule aufzusteigen, bilden den Kern der Handlung, während die Charaktere mit ihren eigenen Schwächen und Zielen konfrontiert werden.