Die Handlung von "The Super Mario Bros. Movie" (Film) dreht sich um die Abenteuer der Brüder Mario und Luigi, die in einer fantastischen Welt voller Gefahren und Wunder landen. Die Geschichte beginnt in Brooklyn, New York, wo die beiden Brüder als Klempner arbeiten. Durch einen mysteriösen Kanalisationseingang gelangen sie in das Pilzkönigreich, eine magische Welt, die von der bösen Schildkrötenkönigin Koopa bedroht wird. Koopa hat die Prinzessin des Königreichs, Prinzessin Peach, entführt und plant, die Macht über das gesamte Land an sich zu reißen.

Mario und Luigi treffen auf eine Reihe von Charakteren, darunter Toad, ein loyaler Diener der Prinzessin, der ihnen hilft, sich in der neuen Welt zurechtzufinden. Die Brüder müssen sich verschiedenen Herausforderungen stellen, darunter gefährliche Kreaturen, knifflige Rätsel und Koopas Armee. Während ihrer Reise entdecken sie, dass sie besondere Fähigkeiten besitzen, die ihnen im Kampf gegen Koopa nützlich sind. Mario zeigt sich als mutiger und entschlossener Anführer, während Luigi sich als ängstlicher, aber loyaler Begleiter erweist.

Die Handlung entwickelt sich zu einem epischen Kampf zwischen Gut und Böse, bei dem die Brüder versuchen, Prinzessin Peach zu retten und das Pilzkönigreich zu befreien. Dabei lernen sie, dass Teamwork und Mut entscheidend sind, um Koopas Pläne zu vereiteln. Der Film endet mit einem triumphalen Sieg der Brüder, die das Königreich retten und den Frieden wiederherstellen. Die Charaktere kehren schließlich nach Brooklyn zurück, aber die Erinnerungen an ihre Abenteuer im Pilzkönigreich bleiben lebendig.