Die Anime-Filmtrilogie ".hack//G.U. Trilogy" basiert auf der gleichnamigen Videospielreihe und spielt in der virtuellen MMORPG-Welt "The World R:2". Die Handlung konzentriert sich auf Haseo, einen erfahrenen Spieler, der unter dem Rufnamen "Der Terror des Todes" bekannt ist. Haseo sucht Rache an Tri-Edge, einem mysteriösen Charakter, der seinen Freund Shino in einen komatösen Zustand versetzt hat. Im Verlauf der Geschichte wird deutlich, dass Tri-Edge mit dem Phänomen der "Epitaph Users" verbunden ist, Spielern, die über außergewöhnliche Fähigkeiten verfügen und eine Bedrohung für die Stabilität der virtuellen Welt darstellen.

Haseo schließt sich der Gilde "Canard" an und trifft auf verschiedene Charaktere, darunter Atoli, eine sanftmütige Spielerin, die sich um andere kümmert, und Kuhn, einen strategisch denkenden Anführer. Zusammen versuchen sie, die Geheimnisse hinter Tri-Edge und den Epitaph Users zu lüften. Dabei stoßen sie auf AIDA, eine feindliche KI, die die Spieler angreift und deren Daten korrumpiert. Die Handlung vertieft sich in die Beziehung zwischen der virtuellen und der realen Welt, da die Auswirkungen von AIDA auch auf das reale Leben der Spieler übergreifen.

Im Laufe der Trilogie entwickelt sich Haseo von einem rachsüchtigen Einzelgänger zu einem verantwortungsbewussten Anführer, der die Sicherheit seiner Freunde und der gesamten Spielergemeinschaft schützen will. Die Geschichte erreicht ihren Höhepunkt, als Haseo sich Tri-Edge in einem finalen Kampf stellt und die wahren Absichten von AIDA sowie die Verbindung zwischen "The World R:2" und der realen Welt enthüllt werden. Die Trilogie verbindet Action, Mystery und emotionale Tiefe, während sie die Grenzen zwischen virtueller und realer Identität erforscht.