"Zoids Wild Zero" ist eine Anime-Serie, die in einer Welt spielt, in welche die Menschheit gezwungen ist, nach einer globalen Katastrophe auf dem Mond zu leben. Die Handlung konzentriert sich auf die Rückkehr der Menschen zur Erde, die nun von wilden Tieren und mysteriösen mechanischen Kreaturen, den sogenannten Zoids, bewohnt wird. Die Serie folgt dem jungen Protagonisten Leo Conrad, einem Mitglied der Raumfahrtbehörde BAHRAM, der zusammen mit seinem Team auf die Erde geschickt wird, um die Überreste der menschlichen Zivilisation zu erkunden und die Möglichkeit einer Rückkehr der Menschheit zu prüfen.

Leo stößt auf einen alten Zoid namens Liger Zero, der eine besondere Verbindung zu ihm hat. Liger Zero ist ein mächtiger und intelligenter Zoid, der Leo bei seinen Abenteuern unterstützt. Zusammen mit seiner Crew, darunter die Pilotin Sara, der Techniker Buzz und der Wissenschaftler Dr. Layon, erkundet Leo die gefährliche und unberechenbare Erde. Dabei treffen sie auf verschiedene Fraktionen, darunter die BAHRAM-Organisation selbst, die eigene Ziele verfolgt, sowie auf andere Überlebende, die sich an die neue Umgebung angepasst haben.

Die Serie thematisiert den Kampf ums Überleben in einer feindlichen Umgebung, die Entdeckung der Geheimnisse der Zoids und die moralischen Dilemmata, die mit der Rückkehr der Menschheit zur Erde verbunden sind. Leo und seine Freunde müssen nicht nur gegen wilde Zoids und natürliche Gefahren kämpfen, sondern auch gegen menschliche Gegner, die ihre eigenen Pläne für die Zukunft der Erde haben. Dabei wird die Beziehung zwischen Mensch und Zoid immer wieder in den Vordergrund gestellt, insbesondere die besondere Verbindung zwischen Leo und Liger Zero.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Mischung aus Action, Abenteuer und Science-Fiction-Elementen, wobei die Charaktere ständig mit neuen Herausforderungen konfrontiert werden. Die Serie bietet eine Mischung aus episodischen Abenteuern und einer übergeordneten Handlung, die sich um die Geheimnisse der Zoids und die Zukunft der Menschheit dreht.