"Evangelion: 3.0 You Can (Not) Redo" ist der dritte Film der "Rebuild of Evangelion"-Filmreihe, die auf der ursprünglichen Serie "Neon Genesis Evangelion" basiert. Der Film setzt 14 Jahre nach den Ereignissen von "Evangelion: 2.0 You Can (Not) Advance" ein. Shinji Ikari, der Protagonist, erwacht aus einem Koma und findet eine völlig veränderte Welt vor. Die Erde ist durch den sogenannten "Near Third Impact" verwüstet, und die Menschheit steht am Rande der Auslöschung. Die Organisation WILLE, angeführt von Misato Katsuragi, bekämpft die verbliebenen Feinde, darunter auch NERV, die Organisation, für die Shinji einst kämpfte.

Shinji wird von WILLE aufgenommen, doch er wird mit Feindseligkeit und Misstrauen behandelt, da er für die Katastrophe verantwortlich gemacht wird. WILLE besitzt ein neues Schiff, die Wunder, und setzt sich gegen NERV und deren Evangelion-Einheiten zur Wehr. Shinji trifft auf Kaworu Nagisa, einen mysteriösen Jungen, der behauptet, Shinji helfen zu wollen, die Welt wiederherzustellen. Kaworu führt Shinji zu NERVs Hauptquartier, wo sie versuchen, den Speer von Longinus zu verwenden, um die Schäden des Near Third Impact rückgängig zu machen.

Im Verlauf des Films wird deutlich, dass Shinjis Handlungen, insbesondere sein Versuch, die Welt zu retten, unbeabsichtigte und verheerende Konsequenzen hatten. Die Beziehung zwischen Shinji und Kaworu entwickelt sich, wobei Kaworu eine zentrale Rolle in Shinjis emotionaler Entwicklung spielt. Der Film endet mit einem dramatischen Höhepunkt, als Shinji und Kaworu versuchen, den Speer zu aktivieren, was jedoch zu einem weiteren katastrophalen Ereignis führt. Shinji wird erneut mit den Folgen seiner Entscheidungen konfrontiert, während die Welt weiterhin am Abgrund steht.

Die Charaktere, darunter Shinji, Misato, Asuka Langley Shikinami, Rei Ayanami und Kaworu, sind zentral für die Handlung. Jeder von ihnen trägt zur komplexen Dynamik bei, die von Schuld, Verantwortung und dem Kampf um Erlösung geprägt ist. Der Film vertieft die psychologischen und philosophischen Themen, die die "Evangelion"-Reihe auszeichnen, und führt die Handlung in eine düstere und ungewisse Richtung.