"Shakugan no Shana S" ist eine 4-teilige OVA-Serie, die als Fortsetzung der ersten Staffel der Anime-Serie "Shakugan no Shana" fungiert. Die Handlung setzt nach den Ereignissen der ersten Staffel ein und vertieft die Beziehung zwischen den Hauptcharakteren sowie die Konflikte in der Welt der Flamme und der Kräfte der Karmesinroten Welt.

Die Geschichte spielt in einer Welt, in der mystische Wesen, bekannt als Rinne, die Existenz von Menschen verzehren, um ihre eigene Energie aufrechtzuerhalten. Diese Wesen existieren in einer parallelen Dimension, die als Karmesinrote Welt bezeichnet wird. Um die Balance zwischen den Welten zu wahren, kämpfen Krieger, sogenannte Flammenschwerter, gegen die Rinne. Die Protagonistin, Shana, ist eine Flammenschwert-Kriegerin, die den Titel "Flammenhairige Flammenschwert-Kriegerin" trägt. Sie ist mit dem mystischen Schwert "Nietono no Shana" ausgestattet und hat die Aufgabe, die Rinne zu bekämpfen.

Der menschliche Protagonist, Yuji Sakai, ist ein normaler Schüler, der versehentlich in die Konflikte zwischen den Welten hineingezogen wird. Nachdem er von einem Rinne angegriffen wird, entdeckt er, dass er ein "Fackel" ist – ein menschliches Wesen, dessen Existenz bereits verzehrt wurde und das nur noch als temporäre Erinnerung in der Welt verbleibt. Trotz seines Schicksals entwickelt Yuji eine enge Bindung zu Shana und wird in ihre Kämpfe verwickelt.

In "Shakugan no Shana S" wird die Beziehung zwischen Shana und Yuji weiterentwickelt, während neue Bedrohungen auftauchen. Die OVA-Serie führt neue Charaktere ein, darunter Pheles, eine mysteriöse Frau, die eine Verbindung zu Yujis Vergangenheit hat. Pheles spielt eine zentrale Rolle in der Handlung, da sie Yuji dazu drängt, sich seiner wahren Natur zu stellen und Entscheidungen zu treffen, die sowohl seine eigene Existenz als auch die Zukunft der Welten beeinflussen.

Die Serie behandelt Themen wie Identität, Schicksal und die moralischen Dilemmata, die mit der Existenz als Fackel verbunden sind. Die Handlung ist geprägt von emotionalen Konflikten, Kämpfen zwischen den Flammenschwert-Kriegern und den Rinne sowie der fortlaufenden Entwicklung der Beziehung zwischen Shana und Yuji. Die OVA-Serie dient als Brücke zwischen der ersten und zweiten Staffel der Hauptserie und bietet Einblicke in die Hintergründe der Charaktere und die komplexe Mythologie der Welt.