"Mobile Suit Gundam Thunderbolt: Bandit Flower" ist ein Anime-Film, der im Universal Century-Zeitalter des Gundam-Universums spielt und die Ereignisse des OVA "Mobile Suit Gundam Thunderbolt" fortsetzt. Der Film konzentriert sich auf die anhaltenden Konflikte zwischen der Earth Federation und den Überresten des Principality of Zeon, insbesondere in der Region "Thunderbolt Sector", einem zerstörten Gebiet voller Weltraumschrott.

Die Handlung dreht sich um Io Fleming, einen talentierten, aber rücksichtslosen Piloten der Earth Federation, der den experimentellen Gundam RX-78AL Atlas Gundam steuert. Auf der Gegenseite steht Daryl Lorenz, ein ehemaliger Zeon-Pilot, der nach dem Verlust seiner Beine nun in einem speziell angepassten Mobile Suit, dem MS-06R Zaku II High Mobility Type, kämpft. Beide Charaktere sind von den Gräueln des Krieges gezeichnet und werden durch ihre persönlichen Motivationen angetrieben, wobei ihre Wege sich erneut kreuzen.

Der Film führt auch neue Charaktere ein, darunter Claudia Peer, eine ehemalige Zeon-Pilotin, die sich der Earth Federation anschließt, und Bianca Carlyle, eine Wissenschaftlerin, die an der Entwicklung des Atlas Gundam beteiligt ist. Die Handlung vertieft die psychologischen und moralischen Dilemmata der Charaktere, während sie in einem gnadenlosen Krieg ums Überleben kämpfen. Der Fokus liegt auf den strategischen Manövern und den technologischen Fortschritten, die beide Seiten einsetzen, um die Oberhand zu gewinnen.

Der Thunderbolt Sector bleibt ein zentraler Schauplatz, der nicht nur als Schlachtfeld dient, sondern auch als Symbol für die Zerstörung und Hoffnungslosigkeit des Krieges. Der Film untersucht die Auswirkungen des Konflikts auf die Soldaten und Zivilisten, die in dieser chaotischen Umgebung gefangen sind. Die Handlung ist geprägt von intensiven Mobile-Suit-Kämpfen, politischen Intrigen und den persönlichen Tragödien der Charaktere, die in einem Krieg gefangen sind, der keine klaren Gewinner kennt.