"Mobile Suit Gundam 0083: Stardust Memory (Manga)" ist eine Adaption der gleichnamigen OVA-Serie und spielt im Universal Century-Zeitalter des Gundam-Universums. Die Handlung beginnt im Jahr U.C. 0083, drei Jahre nach dem Ende des One Year War zwischen der Erde und den Raumkolonien. Die Erde wird von der Earth Federation regiert, während die verbliebenen Kräfte des Principality of Zeon, bekannt als Zeon-Rebellen, weiterhin Widerstand leisten.

Die Geschichte konzentriert sich auf die Entwicklungen rund um die Operation Stardust, einen verdeckten Plan der Zeon-Rebellen, um die Earth Federation zu destabilisieren. Der Protagonist, Kou Uraki, ist ein junger Testpilot der Federation, der versehentlich in die Ereignisse verwickelt wird, als die Zeon-Rebellen unter der Führung von Anavel Gato zwei Prototypen von Gundam-Mobile Suits stehlen. Einer dieser Prototypen, der GP02A "Physalis", ist mit einer Atomwaffe ausgestattet, die im One Year War verboten wurde. Kou übernimmt den zweiten Prototypen, den GP01 "Zephyranthes", und versucht, Gato aufzuhalten.

Die Handlung folgt Kou und seinen Verbündeten, darunter die Ingenieurin Nina Purpleton und der erfahrene Pilot Chuck Keith, während sie gegen die Zeon-Rebellen kämpfen. Gato, auch bekannt als "Nightmare of Solomon", ist ein charismatischer und entschlossener Anführer, der für seine Loyalität gegenüber Zeon und seine Fähigkeiten als Pilot gefürchtet ist. Die Konflikte zwischen Kou und Gato werden sowohl auf der Erde als auch im Weltraum ausgetragen, wobei die Spannungen zwischen den beiden Piloten und ihren unterschiedlichen Ideologien im Mittelpunkt stehen.

Im Verlauf der Geschichte wird die Operation Stardust enthüllt, bei der die Zeon-Rebellen einen Asteroiden auf einen Kurs zur Erde lenken, um die Federation zu zwingen, ihre militärische Präsenz im Weltraum zu verstärken. Dies führt zu politischen Machtkämpfen innerhalb der Federation und der Entstehung der Titans, einer elitären und oft brutalen Militäreinheit, die später eine zentrale Rolle in der Gundam-Zeitlinie spielt.

Die Charaktere entwickeln sich im Laufe der Handlung, wobei Kou von einem unerfahrenen Piloten zu einem entschlossenen Kämpfer reift. Nina spielt eine Schlüsselrolle in der Entwicklung der Gundam-Prototypen und steht im Konflikt zwischen ihrer Loyalität zur Federation und ihren persönlichen Gefühlen. Gato bleibt bis zum Ende ein überzeugter Verteidiger der Zeon-Ideale, was ihn zu einem der prägendsten Antagonisten der Serie macht.

Die Handlung endet mit dem Abschluss der Operation Stardust und den weitreichenden politischen Folgen für die Earth Federation. Die Ereignisse legen den Grundstein für die späteren Konflikte im Universal Century, insbesondere für den Aufstieg der Titans und die Spannungen, die in "Mobile Suit Zeta Gundam" weiterverfolgt werden.