"Gundam Perfect Mission" ist eine OVA, die im Rahmen des Gundam-Universums spielt und eine eigenständige Geschichte präsentiert. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe von Piloten, die in einem Konflikt zwischen zwei rivalisierenden Fraktionen verwickelt sind. Die Protagonisten, darunter der talentierte Pilot Alex und die taktisch versierte Kommandantin Lena, werden mit einer kritischen Mission betraut: die Zerstörung einer geheimen Waffe, die von der gegnerischen Fraktion entwickelt wurde. Diese Waffe, bekannt als "Perfect System", hat das Potenzial, das Gleichgewicht der Macht im Krieg erheblich zu verschieben.

Die Mission führt die Gruppe durch eine Reihe von Gefechten, bei denen sie auf feindliche Mobile Suits und strategische Fallen treffen. Während des Fortschritts der Mission werden die Charaktere mit moralischen Dilemmata und persönlichen Konflikten konfrontiert, die ihre Loyalität und Entschlossenheit auf die Probe stellen. Alex, der zunächst als Einzelgänger agiert, muss lernen, im Team zu arbeiten, während Lena mit den Konsequenzen ihrer Entscheidungen als Anführerin ringt.

Ein zentrales Element der Handlung ist die Interaktion zwischen den Charakteren und ihren Mobile Suits, die nicht nur als Kriegsgeräte, sondern auch als Symbole für ihre individuellen Stärken und Schwächen dienen. Die OVA beleuchtet die technologischen Aspekte der Mobile Suits sowie deren Rolle im Kampfgeschehen. Die finale Konfrontation mit dem "Perfect System" stellt den Höhepunkt der Geschichte dar, bei dem die Protagonisten ihre Fähigkeiten und ihren Zusammenhalt unter Beweis stellen müssen, um die Mission erfolgreich abzuschließen.

Die OVA bietet eine kompakte Erzählung, die sich auf die Dynamik zwischen den Charakteren und die strategischen Elemente des Krieges konzentriert, ohne dabei die typischen Themen des Gundam-Universums wie Konflikt, Technologie und menschliche Emotionen außer Acht zu lassen.