"Mobile Suit Gundam 0079 (Manga)" ist eine Adaption der klassischen Anime-Serie, die im Universum des Universal Century spielt. Die Handlung beginnt während des Konflikts zwischen der Erde und ihren Kolonien, bekannt als der One Year War. Die Erde wird von der Erdföderation regiert, während die Kolonisten, die sich selbst als Principality of Zeon bezeichnen, für ihre Unabhängigkeit kämpfen. Der Krieg hat bereits unzählige Opfer gefordert, und beide Seiten setzen auf mobile Waffen, sogenannte Mobile Suits, um die Schlachten zu entscheiden.

Die Geschichte konzentriert sich auf Amuro Ray, einen jungen Techniker, der zufällig in den Besitz des RX-78-2 Gundam gelangt, einem hochmodernen Mobile Suit der Erdföderation. Als die Kolonie Side 7, in der Amuro lebt, von Zeon-Truppen angegriffen wird, ist er gezwungen, den Gundam zu pilotieren, um sich und seine Freunde zu verteidigen. Dabei schließt er sich der Besatzung des Raumschiffs White Base an, einem Schlachtschiff der Erdföderation, das ebenfalls auf der Kolonie stationiert ist.

Die Besatzung der White Base, darunter der erfahrene Offizier Bright Noa und die junge Kommunikationsspezialistin Mirai Yashima, wird zu einer wichtigen Einheit im Kampf gegen Zeon. Während ihrer Reise begegnen sie immer wieder Char Char Aznable, einem charismatischen und fähigen Zeon-Piloten, der sich als einer ihrer gefährlichsten Gegner erweist. Die Konflikte zwischen Amuro und Char bilden einen zentralen Handlungsstrang, da beide Figuren sich gegenseitig herausfordern und ihre Fähigkeiten weiterentwickeln.

Im Laufe der Geschichte wird Amuro von einem unerfahrenen Jugendlichen zu einem erfahrenen Piloten, der sich seiner Verantwortung bewusst wird. Gleichzeitig wird die moralische Komplexität des Krieges thematisiert, da beide Seiten Grausamkeiten begehen und die Zivilbevölkerung unter den Folgen des Konflikts leidet. Die Handlung behandelt Themen wie die Auswirkungen des Krieges auf Individuen, die Entwicklung von Technologie und die Frage, ob Fortschritt immer mit Zerstörung einhergeht.

Neben den militärischen Auseinandersetzungen spielen auch die persönlichen Beziehungen der Charaktere eine wichtige Rolle. Amuro entwickelt eine enge Bindung zu seinen Mitstreitern auf der White Base, darunter Fraw Bow, eine Freundin aus seiner Heimatkolonie, und Hayato Kobayashi, ein weiterer junger Pilot. Diese Beziehungen tragen dazu bei, die emotionalen Aspekte der Geschichte zu vertiefen und die Auswirkungen des Krieges auf das menschliche Leben zu verdeutlichen.

Die Handlung gipfelt in einer Reihe von entscheidenden Schlachten, die das Schicksal des Krieges bestimmen. Amuro und seine Verbündeten müssen sich nicht nur gegen die militärische Übermacht von Zeon behaupten, sondern auch mit den inneren Konflikten und moralischen Dilemmata umgehen, die der Krieg mit sich bringt. Die Geschichte endet mit einem offenen Ausblick auf die Zukunft, der Raum für weitere Entwicklungen im Universal Century lässt.